More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03856 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  47.03 
 
 		 882 aa  699    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  44.61 
 
 		 893 aa  701    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  46.79 
 
 		 882 aa  697    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  44.42 
 
 		 902 aa  685    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  45.69 
 
 		 881 aa  714    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  100 
 
 		 904 aa  1841    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  42.84 
 
 		 875 aa  728    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  46.98 
 
 		 889 aa  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  44.8 
 
 		 898 aa  630  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  39.68 
 
 		 864 aa  619  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  43.54 
 
 		 849 aa  612  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.59 
 
 		 712 aa  493  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  36.22 
 
 		 966 aa  479  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  33.4 
 
 		 886 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  52.45 
 
 		 733 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  50.7 
 
 		 717 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  34.54 
 
 		 831 aa  438  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  52.53 
 
 		 905 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  35.18 
 
 		 914 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  34.29 
 
 		 915 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.7 
 
 		 814 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  30.6 
 
 		 866 aa  357  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  30.93 
 
 		 857 aa  354  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  29.93 
 
 		 832 aa  352  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.99 
 
 		 820 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  31.47 
 
 		 823 aa  350  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.73 
 
 		 870 aa  341  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  28.68 
 
 		 913 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  28.57 
 
 		 913 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  30.38 
 
 		 887 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  29.76 
 
 		 897 aa  327  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  30.14 
 
 		 884 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  29.47 
 
 		 906 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 913 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  30.24 
 
 		 772 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  30.93 
 
 		 836 aa  303  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.07 
 
 		 839 aa  302  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.08 
 
 		 1212 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  26.94 
 
 		 839 aa  283  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.12 
 
 		 1357 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.5 
 
 		 1343 aa  274  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  27.92 
 
 		 843 aa  273  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  36.27 
 
 		 1548 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  27.6 
 
 		 845 aa  263  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  27.53 
 
 		 843 aa  263  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  26.32 
 
 		 851 aa  262  2e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  27.9 
 
 		 833 aa  253  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 805 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  31.25 
 
 		 927 aa  253  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  39.95 
 
 		 763 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38 
 
 		 762 aa  250  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  27.74 
 
 		 838 aa  243  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.08 
 
 		 756 aa  243  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.89 
 
 		 813 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  38.4 
 
 		 777 aa  239  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  35.43 
 
 		 778 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  36.28 
 
 		 803 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  35.51 
 
 		 778 aa  234  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  27.63 
 
 		 850 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  30.55 
 
 		 832 aa  230  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.07 
 
 		 807 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  27.77 
 
 		 852 aa  229  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.49 
 
 		 927 aa  227  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  37.94 
 
 		 874 aa  226  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  28.05 
 
 		 897 aa  226  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  26.91 
 
 		 738 aa  224  4e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  27.18 
 
 		 738 aa  224  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.77 
 
 		 792 aa  221  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  36.36 
 
 		 808 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.27 
 
 		 754 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  32.77 
 
 		 972 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.83 
 
 		 771 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  36.58 
 
 		 772 aa  213  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.71 
 
 		 820 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  43.01 
 
 		 763 aa  213  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.71 
 
 		 988 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  33.81 
 
 		 787 aa  210  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.41 
 
 		 874 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.05 
 
 		 923 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  43.1 
 
 		 764 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.19 
 
 		 734 aa  209  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  36.83 
 
 		 928 aa  208  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.8 
 
 		 795 aa  207  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  42.41 
 
 		 764 aa  207  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  32.81 
 
 		 790 aa  207  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 		 769 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.47 
 
 		 974 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  36.99 
 
 		 743 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39 
 
 		 769 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 782 aa  205  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  39.66 
 
 		 755 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  39.66 
 
 		 765 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  39.66 
 
 		 755 aa  205  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.99 
 
 		 766 aa  204  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  39.66 
 
 		 755 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.33 
 
 		 769 aa  204  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  34.83 
 
 		 747 aa  204  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.92 
 
 		 783 aa  204  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  39.32 
 
 		 755 aa  203  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 		 784 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>