More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4787 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
820 aa  1667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  54.04 
 
 
915 aa  840    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  52.88 
 
 
914 aa  825    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  71.76 
 
 
823 aa  1223    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  50.8 
 
 
836 aa  752    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.23 
 
 
814 aa  729    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  41.95 
 
 
845 aa  605  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  38.76 
 
 
843 aa  569  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  38.77 
 
 
843 aa  570  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  38.69 
 
 
851 aa  565  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  38.72 
 
 
839 aa  554  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  38.81 
 
 
833 aa  544  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  37.23 
 
 
838 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  37.27 
 
 
831 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  37.97 
 
 
850 aa  511  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  38.07 
 
 
738 aa  505  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  38.2 
 
 
738 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.53 
 
 
818 aa  492  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  39.02 
 
 
832 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  35.6 
 
 
852 aa  478  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.5 
 
 
813 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.23 
 
 
820 aa  465  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  34.37 
 
 
857 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  33.93 
 
 
887 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  33.09 
 
 
870 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 
866 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  32.46 
 
 
832 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  38.09 
 
 
805 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.72 
 
 
839 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.46 
 
 
874 aa  409  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  32.02 
 
 
913 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 
913 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  32.09 
 
 
897 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  33.29 
 
 
884 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  31.67 
 
 
913 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  35.32 
 
 
927 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  30.85 
 
 
906 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  34.88 
 
 
578 aa  359  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.45 
 
 
966 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.99 
 
 
904 aa  356  7.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  32 
 
 
897 aa  353  8.999999999999999e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  31.77 
 
 
772 aa  351  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  30.53 
 
 
886 aa  350  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  32.07 
 
 
816 aa  343  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.47 
 
 
757 aa  324  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  43.26 
 
 
749 aa  320  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.18 
 
 
749 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.18 
 
 
758 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.55 
 
 
750 aa  311  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.46 
 
 
755 aa  308  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  43.56 
 
 
747 aa  302  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.21 
 
 
748 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  41.6 
 
 
800 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  44.26 
 
 
740 aa  294  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.55 
 
 
751 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  45.18 
 
 
750 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  41.67 
 
 
762 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.9 
 
 
711 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  41.82 
 
 
755 aa  289  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  43.56 
 
 
777 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.39 
 
 
790 aa  284  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  41.07 
 
 
721 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  43.63 
 
 
708 aa  282  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  40.82 
 
 
722 aa  281  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  42.93 
 
 
760 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.41 
 
 
737 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.25 
 
 
813 aa  278  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  41.44 
 
 
716 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  38.17 
 
 
717 aa  274  5.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.81 
 
 
757 aa  274  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.84 
 
 
741 aa  272  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  42.82 
 
 
701 aa  272  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  40.05 
 
 
757 aa  271  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.38 
 
 
988 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.97 
 
 
780 aa  270  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  37.85 
 
 
714 aa  267  5.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.2 
 
 
742 aa  266  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.91 
 
 
927 aa  266  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  27.07 
 
 
875 aa  266  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  40.59 
 
 
737 aa  265  3e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  28.44 
 
 
882 aa  265  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  38.11 
 
 
745 aa  265  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.93 
 
 
758 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  28.32 
 
 
882 aa  264  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.09 
 
 
734 aa  263  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  31.24 
 
 
902 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  29.68 
 
 
889 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  35.76 
 
 
895 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.94 
 
 
746 aa  257  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  30.91 
 
 
849 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  36.07 
 
 
721 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  28.01 
 
 
972 aa  252  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.57 
 
 
809 aa  251  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 
793 aa  250  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  38.03 
 
 
793 aa  250  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  28.78 
 
 
881 aa  250  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  39.18 
 
 
814 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.23 
 
 
756 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.02 
 
 
738 aa  245  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  25.66 
 
 
893 aa  244  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>