More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3246 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  43.45 
 
 		 882 aa  662    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  41.47 
 
 		 893 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  43.22 
 
 		 889 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  43.55 
 
 		 882 aa  664    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  43.47 
 
 		 902 aa  682    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  100 
 
 		 881 aa  1821    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  45.51 
 
 		 904 aa  717    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  47.79 
 
 		 898 aa  735    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  41.53 
 
 		 875 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  38.92 
 
 		 864 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  40.23 
 
 		 849 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.3 
 
 		 712 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.93 
 
 		 966 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  31.74 
 
 		 886 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  48.12 
 
 		 905 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  45.67 
 
 		 717 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  44.14 
 
 		 733 aa  364  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  30.51 
 
 		 972 aa  357  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.32 
 
 		 927 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  34.12 
 
 		 875 aa  324  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  31.75 
 
 		 934 aa  323  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  31.85 
 
 		 914 aa  317  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 831 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.58 
 
 		 866 aa  297  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  30.72 
 
 		 915 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.06 
 
 		 870 aa  294  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.9 
 
 		 839 aa  290  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  29.02 
 
 		 949 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  29.86 
 
 		 887 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  38.43 
 
 		 763 aa  281  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.75 
 
 		 814 aa  277  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  30.69 
 
 		 927 aa  272  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 913 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  28.34 
 
 		 857 aa  269  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  28.59 
 
 		 832 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  29.21 
 
 		 897 aa  268  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  28.37 
 
 		 913 aa  265  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  27.94 
 
 		 913 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  35.87 
 
 		 803 aa  263  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  29.66 
 
 		 823 aa  262  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  29.13 
 
 		 906 aa  260  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  28.01 
 
 		 845 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  27.46 
 
 		 843 aa  255  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  28.64 
 
 		 851 aa  253  9.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  30.09 
 
 		 897 aa  251  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  28.83 
 
 		 833 aa  247  6e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  28.51 
 
 		 843 aa  245  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  27.88 
 
 		 884 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.78 
 
 		 820 aa  244  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  29.28 
 
 		 772 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  36.69 
 
 		 874 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  30.08 
 
 		 832 aa  235  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.64 
 
 		 1212 aa  234  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.85 
 
 		 1357 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.13 
 
 		 778 aa  231  5e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  35.55 
 
 		 778 aa  230  9e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.38 
 
 		 792 aa  230  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.14 
 
 		 988 aa  230  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.35 
 
 		 762 aa  229  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.83 
 
 		 1343 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 		 756 aa  227  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.12 
 
 		 974 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  35.28 
 
 		 772 aa  225  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  27.18 
 
 		 839 aa  224  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  32.01 
 
 		 1548 aa  224  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.59 
 
 		 813 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  35.48 
 
 		 928 aa  221  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  31.56 
 
 		 817 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.11 
 
 		 773 aa  220  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.27 
 
 		 784 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 894 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  35.37 
 
 		 952 aa  217  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  36.1 
 
 		 805 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.07 
 
 		 769 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.63 
 
 		 782 aa  213  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  33.56 
 
 		 777 aa  212  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  35.78 
 
 		 811 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.13 
 
 		 790 aa  210  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.51 
 
 		 771 aa  207  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.22 
 
 		 824 aa  207  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 755 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 755 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 755 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 755 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 765 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  26.26 
 
 		 838 aa  205  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  34.14 
 
 		 747 aa  204  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.03 
 
 		 772 aa  201  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.55 
 
 		 765 aa  201  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.55 
 
 		 765 aa  201  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.55 
 
 		 765 aa  201  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.55 
 
 		 765 aa  201  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  27.01 
 
 		 738 aa  200  7.999999999999999e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.55 
 
 		 765 aa  200  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.55 
 
 		 765 aa  200  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  31.55 
 
 		 765 aa  200  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.55 
 
 		 765 aa  200  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 		 806 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.14 
 
 		 923 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  36.72 
 
 		 759 aa  199  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>