More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2168 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  48.46 
 
 		 988 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  100 
 
 		 875 aa  1738    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  50.64 
 
 		 928 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  52.96 
 
 		 934 aa  732    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  53.2 
 
 		 923 aa  738    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  49.13 
 
 		 811 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  45.51 
 
 		 999 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.19 
 
 		 824 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.82 
 
 		 972 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  46.51 
 
 		 974 aa  572  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  46.77 
 
 		 952 aa  568  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  43.92 
 
 		 949 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.1 
 
 		 927 aa  545  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  44.31 
 
 		 874 aa  535  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  34.42 
 
 		 972 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.63 
 
 		 851 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  30.59 
 
 		 875 aa  333  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  34.12 
 
 		 881 aa  330  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  31.64 
 
 		 747 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 		 805 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  29.11 
 
 		 886 aa  245  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.7 
 
 		 790 aa  244  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  35.54 
 
 		 733 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  30.11 
 
 		 802 aa  223  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.02 
 
 		 768 aa  222  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  32.72 
 
 		 1037 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  38.92 
 
 		 902 aa  221  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  36.01 
 
 		 864 aa  220  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  37.91 
 
 		 893 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.46 
 
 		 889 aa  217  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.2 
 
 		 712 aa  210  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  26.9 
 
 		 866 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  36.27 
 
 		 905 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  39.02 
 
 		 882 aa  204  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.26 
 
 		 904 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  32.32 
 
 		 832 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  35.71 
 
 		 882 aa  201  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  32.93 
 
 		 717 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  40.7 
 
 		 849 aa  198  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  26.16 
 
 		 857 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  26.11 
 
 		 887 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 		 832 aa  191  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  36.32 
 
 		 898 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.6 
 
 		 1212 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  33.57 
 
 		 1548 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  30.63 
 
 		 793 aa  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.3 
 
 		 1357 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  25.72 
 
 		 897 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  30.18 
 
 		 789 aa  165  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  32 
 
 		 966 aa  161  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  35.09 
 
 		 721 aa  160  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.36 
 
 		 738 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  33.08 
 
 		 763 aa  158  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.2 
 
 		 1343 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.74 
 
 		 778 aa  153  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  28.81 
 
 		 778 aa  151  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  25.22 
 
 		 884 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.22 
 
 		 762 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.21 
 
 		 751 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.09 
 
 		 755 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.41 
 
 		 902 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.96 
 
 		 799 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  39.36 
 
 		 914 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  33.79 
 
 		 808 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  36.64 
 
 		 823 aa  143  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  29.62 
 
 		 745 aa  144  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.06 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  39.01 
 
 		 915 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  31.25 
 
 		 803 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  27.43 
 
 		 759 aa  142  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  36.86 
 
 		 740 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.31 
 
 		 782 aa  140  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.23 
 
 		 771 aa  140  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  41.15 
 
 		 895 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.46 
 
 		 784 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.89 
 
 		 777 aa  140  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.42 
 
 		 756 aa  140  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.98 
 
 		 760 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  33.63 
 
 		 758 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.46 
 
 		 792 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35668  beta-xylosidase  26.55 
 
 		 682 aa  139  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  34.06 
 
 		 693 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.92 
 
 		 754 aa  138  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  36 
 
 		 721 aa  138  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.15 
 
 		 771 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  34.21 
 
 		 870 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  35.52 
 
 		 774 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  29.81 
 
 		 787 aa  137  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.42 
 
 		 795 aa  137  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  32.95 
 
 		 750 aa  137  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  36.64 
 
 		 838 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  29.63 
 
 		 777 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.8 
 
 		 772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.81 
 
 		 742 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  31.56 
 
 		 743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.03 
 
 		 807 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 		 755 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.8 
 
 		 769 aa  135  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  30.43 
 
 		 765 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.31 
 
 		 750 aa  135  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>