More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2378 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  48.44 
 
 		 882 aa  781    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  47.79 
 
 		 849 aa  727    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  42.15 
 
 		 893 aa  656    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  100 
 
 		 902 aa  1854    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  43.47 
 
 		 881 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  42.62 
 
 		 898 aa  636    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  48.09 
 
 		 882 aa  771    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.42 
 
 		 904 aa  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  48.34 
 
 		 889 aa  801    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  40.69 
 
 		 875 aa  618  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  39.21 
 
 		 864 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  32.96 
 
 		 966 aa  404  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.88 
 
 		 712 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  31.27 
 
 		 886 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  48.54 
 
 		 717 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  48.06 
 
 		 733 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  47.86 
 
 		 905 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.61 
 
 		 988 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.82 
 
 		 927 aa  343  8e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  31.5 
 
 		 914 aa  337  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 		 831 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  32.55 
 
 		 915 aa  321  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.7 
 
 		 866 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  32.15 
 
 		 823 aa  303  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.85 
 
 		 814 aa  300  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  30.28 
 
 		 832 aa  291  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 913 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  29.58 
 
 		 857 aa  289  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  29.6 
 
 		 845 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  29.34 
 
 		 897 aa  282  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.67 
 
 		 870 aa  280  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  29.69 
 
 		 884 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.24 
 
 		 820 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  29.13 
 
 		 906 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  39.09 
 
 		 763 aa  261  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  30 
 
 		 772 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  30.55 
 
 		 836 aa  259  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  37.86 
 
 		 803 aa  258  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  29.07 
 
 		 913 aa  258  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  29.01 
 
 		 913 aa  257  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  29.22 
 
 		 839 aa  256  9e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  29.02 
 
 		 833 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.24 
 
 		 1212 aa  252  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.42 
 
 		 839 aa  247  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  33.82 
 
 		 1548 aa  246  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  31.18 
 
 		 897 aa  244  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.13 
 
 		 1343 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 894 aa  243  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.82 
 
 		 756 aa  241  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  29.82 
 
 		 851 aa  241  5.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  27.36 
 
 		 887 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  32.6 
 
 		 778 aa  238  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  35.48 
 
 		 972 aa  237  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 		 762 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.47 
 
 		 778 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 		 805 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  27.78 
 
 		 843 aa  234  5e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.68 
 
 		 1357 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.21 
 
 		 792 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  38.66 
 
 		 928 aa  231  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  28.21 
 
 		 843 aa  228  5.0000000000000005e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  36.45 
 
 		 874 aa  227  8e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  26.98 
 
 		 738 aa  227  9e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 		 777 aa  225  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  29.21 
 
 		 832 aa  224  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  27.17 
 
 		 738 aa  224  8e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.22 
 
 		 923 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.41 
 
 		 795 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.99 
 
 		 771 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  35.57 
 
 		 934 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  27.48 
 
 		 850 aa  218  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  38.46 
 
 		 772 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.98 
 
 		 784 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  38.92 
 
 		 875 aa  215  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.3 
 
 		 818 aa  215  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  37.24 
 
 		 952 aa  213  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.75 
 
 		 760 aa  213  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.5 
 
 		 974 aa  207  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.64 
 
 		 782 aa  206  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.51 
 
 		 760 aa  204  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  32.58 
 
 		 787 aa  204  6e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  33.55 
 
 		 747 aa  203  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  34.81 
 
 		 949 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.7 
 
 		 807 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.32 
 
 		 790 aa  201  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  32.48 
 
 		 817 aa  200  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.83 
 
 		 769 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.49 
 
 		 765 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  30.92 
 
 		 765 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.49 
 
 		 820 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  30.92 
 
 		 765 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  30.92 
 
 		 765 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  30.92 
 
 		 765 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.92 
 
 		 765 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  30.92 
 
 		 765 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  30.43 
 
 		 765 aa  196  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  30.97 
 
 		 765 aa  196  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  35.93 
 
 		 768 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.19 
 
 		 769 aa  196  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  30.97 
 
 		 765 aa  195  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>