More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01638 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  72.6 
 
 
882 aa  1274    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  56.35 
 
 
849 aa  894    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  49.48 
 
 
902 aa  805    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  43.98 
 
 
881 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  100 
 
 
889 aa  1809    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  45.9 
 
 
898 aa  694    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  72.54 
 
 
882 aa  1267    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  46.98 
 
 
904 aa  724    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  39.93 
 
 
875 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  41.89 
 
 
893 aa  624  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  35.53 
 
 
864 aa  549  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  34.52 
 
 
886 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  46.27 
 
 
717 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.11 
 
 
966 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  45.8 
 
 
905 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  32.76 
 
 
831 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.08 
 
 
712 aa  363  8e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  44.15 
 
 
733 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  30.71 
 
 
972 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.32 
 
 
988 aa  348  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.41 
 
 
814 aa  339  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  32.61 
 
 
914 aa  336  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  32.31 
 
 
915 aa  315  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  29.86 
 
 
857 aa  291  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  30.13 
 
 
866 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 
913 aa  287  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  29.35 
 
 
832 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  29.04 
 
 
870 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  29.21 
 
 
897 aa  281  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  29.42 
 
 
823 aa  278  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  29.04 
 
 
884 aa  277  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  40 
 
 
763 aa  276  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.37 
 
 
839 aa  270  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.97 
 
 
820 aa  268  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  28.18 
 
 
913 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  27.73 
 
 
913 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  28.08 
 
 
906 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  28.99 
 
 
887 aa  262  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  28.16 
 
 
845 aa  259  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  28.23 
 
 
833 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  31.26 
 
 
832 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  29.35 
 
 
772 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.9 
 
 
813 aa  247  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  30.57 
 
 
897 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.01 
 
 
1212 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  29.44 
 
 
850 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  27.57 
 
 
851 aa  240  6.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  26.02 
 
 
839 aa  239  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  27 
 
 
843 aa  238  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  27.33 
 
 
852 aa  232  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  35.06 
 
 
803 aa  230  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  38.54 
 
 
874 aa  229  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  27.09 
 
 
843 aa  228  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  28.08 
 
 
838 aa  227  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  31.11 
 
 
1548 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.9 
 
 
927 aa  219  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35668  beta-xylosidase  34.38 
 
 
682 aa  218  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.17 
 
 
756 aa  218  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  29.7 
 
 
836 aa  217  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.68 
 
 
974 aa  217  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.13 
 
 
1357 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  38.44 
 
 
928 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.91 
 
 
1343 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
894 aa  213  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  36.46 
 
 
875 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  38.04 
 
 
952 aa  206  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.31 
 
 
762 aa  205  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.96 
 
 
923 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  35.21 
 
 
747 aa  203  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  35.59 
 
 
777 aa  203  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  27.99 
 
 
818 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  35.46 
 
 
949 aa  202  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.4 
 
 
851 aa  201  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  37.16 
 
 
790 aa  200  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  36.19 
 
 
811 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.28 
 
 
778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.17 
 
 
765 aa  198  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.17 
 
 
765 aa  198  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  30.28 
 
 
778 aa  199  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.17 
 
 
765 aa  198  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  32.17 
 
 
765 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.97 
 
 
765 aa  197  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  25.37 
 
 
738 aa  197  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.1 
 
 
765 aa  197  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.97 
 
 
765 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.76 
 
 
765 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.97 
 
 
765 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.97 
 
 
765 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  36 
 
 
934 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.3 
 
 
772 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  33.58 
 
 
755 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  25.59 
 
 
738 aa  195  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  33.58 
 
 
755 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  33.58 
 
 
755 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  33.58 
 
 
755 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  28.31 
 
 
820 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  34.16 
 
 
763 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  28.9 
 
 
816 aa  192  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.19 
 
 
751 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
760 aa  191  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>