More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65767 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  48.59 
 
 
850 aa  782    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  49.88 
 
 
833 aa  824    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  48.16 
 
 
838 aa  782    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  42.64 
 
 
915 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  42.87 
 
 
914 aa  672    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  52.59 
 
 
851 aa  891    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  66.67 
 
 
738 aa  1047    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  100 
 
 
839 aa  1726    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  66.85 
 
 
738 aa  1045    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  54.11 
 
 
843 aa  892    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  53.82 
 
 
843 aa  904    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.22 
 
 
814 aa  628  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  38.95 
 
 
852 aa  590  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  40.88 
 
 
845 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  38.56 
 
 
823 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  47.03 
 
 
578 aa  549  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.72 
 
 
820 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  37.37 
 
 
836 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  34.04 
 
 
870 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.31 
 
 
818 aa  432  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  34.69 
 
 
866 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  33.7 
 
 
831 aa  429  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  32.3 
 
 
857 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  32.41 
 
 
887 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  32.67 
 
 
832 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  34.07 
 
 
832 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  33.33 
 
 
805 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  32.49 
 
 
913 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.5 
 
 
820 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  31.71 
 
 
913 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.55 
 
 
839 aa  346  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.01 
 
 
874 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  31.43 
 
 
906 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  45.87 
 
 
716 aa  333  6e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  30.93 
 
 
884 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  31.15 
 
 
897 aa  332  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  30.88 
 
 
897 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 
913 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  31.25 
 
 
772 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.09 
 
 
755 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.31 
 
 
966 aa  301  4e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  39.6 
 
 
755 aa  290  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.97 
 
 
758 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.97 
 
 
749 aa  289  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  40.06 
 
 
762 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  26.94 
 
 
904 aa  283  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  30.16 
 
 
886 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.55 
 
 
790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  40.05 
 
 
747 aa  274  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.57 
 
 
741 aa  274  6e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.74 
 
 
757 aa  272  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.4 
 
 
813 aa  270  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.9 
 
 
737 aa  268  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  38.46 
 
 
721 aa  263  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  28.09 
 
 
864 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.52 
 
 
751 aa  260  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.45 
 
 
750 aa  260  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  35.62 
 
 
717 aa  258  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  37.31 
 
 
800 aa  255  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.07 
 
 
813 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  27.92 
 
 
875 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  34.85 
 
 
749 aa  250  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  36.99 
 
 
714 aa  250  9e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  36.8 
 
 
757 aa  248  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.91 
 
 
740 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.32 
 
 
748 aa  244  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  37.04 
 
 
793 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  37.04 
 
 
793 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.68 
 
 
777 aa  243  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  29.22 
 
 
902 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.94 
 
 
750 aa  242  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  37.98 
 
 
816 aa  241  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.71 
 
 
721 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  37.22 
 
 
722 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.22 
 
 
711 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.42 
 
 
809 aa  234  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.38 
 
 
758 aa  233  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.01 
 
 
738 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33 
 
 
780 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  26.66 
 
 
882 aa  232  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.55 
 
 
734 aa  232  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  36.17 
 
 
708 aa  231  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  33.67 
 
 
745 aa  230  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  26.78 
 
 
882 aa  228  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  35.87 
 
 
814 aa  227  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 
742 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  37.19 
 
 
701 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  27.18 
 
 
881 aa  224  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.46 
 
 
737 aa  224  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  25.43 
 
 
889 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.05 
 
 
497 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  26.91 
 
 
898 aa  217  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  34.46 
 
 
760 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  25.47 
 
 
893 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  39.29 
 
 
895 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  33.05 
 
 
874 aa  212  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.89 
 
 
731 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.77 
 
 
731 aa  203  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.17 
 
 
757 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  35.01 
 
 
685 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>