More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0270 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
685 aa  1411    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 
749 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 
758 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.31 
 
 
755 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  35.16 
 
 
793 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  35.3 
 
 
793 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.3 
 
 
757 aa  388  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  34.45 
 
 
755 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  34.2 
 
 
762 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 
800 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.85 
 
 
741 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.03 
 
 
750 aa  363  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  32.99 
 
 
747 aa  363  8e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  31.59 
 
 
738 aa  361  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.7 
 
 
734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.97 
 
 
750 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  32.08 
 
 
745 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  34.51 
 
 
740 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.8 
 
 
717 aa  352  8.999999999999999e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  35.33 
 
 
701 aa  349  9e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  33.87 
 
 
708 aa  345  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.46 
 
 
711 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  32.66 
 
 
749 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.22 
 
 
737 aa  343  5.999999999999999e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  32.28 
 
 
814 aa  343  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  32.92 
 
 
731 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  33.61 
 
 
731 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  32.44 
 
 
731 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  32.31 
 
 
922 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  30.42 
 
 
721 aa  333  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.96 
 
 
1072 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 
780 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.28 
 
 
756 aa  333  8e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.3 
 
 
1158 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  29.92 
 
 
722 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.45 
 
 
790 aa  325  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  33.1 
 
 
748 aa  324  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  30.79 
 
 
721 aa  324  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.31 
 
 
777 aa  324  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  31.57 
 
 
748 aa  321  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  31.21 
 
 
714 aa  320  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  34.21 
 
 
693 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  31.1 
 
 
874 aa  317  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.49 
 
 
933 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  32.32 
 
 
760 aa  312  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  30.16 
 
 
716 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.35 
 
 
742 aa  310  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  31.75 
 
 
731 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33 
 
 
748 aa  310  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.38 
 
 
809 aa  310  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.62 
 
 
751 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  31.46 
 
 
757 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  33.43 
 
 
737 aa  306  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.05 
 
 
758 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33 
 
 
813 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  32.7 
 
 
987 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  33.67 
 
 
691 aa  296  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.89 
 
 
724 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.8 
 
 
737 aa  295  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  30.65 
 
 
1338 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  32.01 
 
 
751 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  32.01 
 
 
751 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  30.97 
 
 
730 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  32.15 
 
 
748 aa  290  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  32.01 
 
 
751 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  32.05 
 
 
779 aa  287  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.19 
 
 
829 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.75 
 
 
1321 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  30.36 
 
 
931 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.44 
 
 
782 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.44 
 
 
746 aa  266  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  29.89 
 
 
735 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.73 
 
 
772 aa  266  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 
778 aa  265  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  28.02 
 
 
772 aa  263  8.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.64 
 
 
778 aa  262  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.39 
 
 
762 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  27.6 
 
 
819 aa  258  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  31.86 
 
 
727 aa  258  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.86 
 
 
727 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.16 
 
 
754 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  28.26 
 
 
743 aa  253  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 
805 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  28.51 
 
 
737 aa  249  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  28.99 
 
 
905 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  29.3 
 
 
743 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.76 
 
 
804 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  37.95 
 
 
831 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 
702 aa  243  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.25 
 
 
777 aa  243  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  44.09 
 
 
914 aa  240  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  41.55 
 
 
913 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  41.37 
 
 
897 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  41.64 
 
 
906 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.29 
 
 
783 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.72 
 
 
760 aa  239  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  29.54 
 
 
750 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.81 
 
 
807 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  27.15 
 
 
822 aa  236  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  28.51 
 
 
765 aa  236  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>