More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2371 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  100 
 
 
931 aa  1885    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  52.83 
 
 
748 aa  678    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  51.61 
 
 
748 aa  684    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  70.97 
 
 
735 aa  1033    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  49.02 
 
 
730 aa  628  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  46.16 
 
 
737 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  42.9 
 
 
731 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  46.78 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  41.98 
 
 
731 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  42.84 
 
 
751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  42.66 
 
 
751 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  42.66 
 
 
751 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  42.51 
 
 
748 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  42.29 
 
 
779 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  39.32 
 
 
922 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  38.72 
 
 
733 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  38.72 
 
 
733 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  38.72 
 
 
733 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  39.46 
 
 
731 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  38.45 
 
 
733 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  38.4 
 
 
733 aa  422  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  37.41 
 
 
731 aa  422  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  37.5 
 
 
733 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  37.63 
 
 
733 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.7 
 
 
1072 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.82 
 
 
749 aa  361  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.82 
 
 
758 aa  361  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.89 
 
 
933 aa  361  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.59 
 
 
1158 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 
734 aa  352  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  32.83 
 
 
745 aa  351  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  34.42 
 
 
755 aa  348  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  35.69 
 
 
987 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.02 
 
 
757 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 
755 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  33.87 
 
 
738 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  31.85 
 
 
762 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.52 
 
 
711 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  30.95 
 
 
721 aa  330  9e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  32.31 
 
 
717 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  33.08 
 
 
737 aa  325  2e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 
747 aa  322  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.43 
 
 
1321 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.66 
 
 
757 aa  318  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  31.83 
 
 
814 aa  314  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.62 
 
 
829 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  35.57 
 
 
693 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.57 
 
 
746 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 
721 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  31.81 
 
 
714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  31.78 
 
 
800 aa  303  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  34.77 
 
 
750 aa  302  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.23 
 
 
790 aa  301  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  33.73 
 
 
701 aa  298  3e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  31.8 
 
 
722 aa  296  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.33 
 
 
1338 aa  295  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  30.39 
 
 
793 aa  294  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  33.89 
 
 
740 aa  294  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  30.24 
 
 
793 aa  293  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.63 
 
 
750 aa  293  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.9 
 
 
758 aa  291  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 
813 aa  288  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.25 
 
 
742 aa  286  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  31.12 
 
 
716 aa  280  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.3 
 
 
780 aa  279  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  32.42 
 
 
749 aa  278  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  33.77 
 
 
760 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  30.59 
 
 
685 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  30.92 
 
 
772 aa  274  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.63 
 
 
777 aa  272  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  40.38 
 
 
549 aa  273  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.9 
 
 
748 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.99 
 
 
741 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.82 
 
 
724 aa  271  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.43 
 
 
751 aa  267  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  32.48 
 
 
708 aa  266  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.55 
 
 
809 aa  266  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.08 
 
 
737 aa  263  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  28.27 
 
 
874 aa  259  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  30.43 
 
 
757 aa  257  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  28.83 
 
 
822 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  28.05 
 
 
819 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.95 
 
 
756 aa  245  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04102  beta-glucosidase (Eurofung)  30.59 
 
 
854 aa  243  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  28.55 
 
 
765 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.48 
 
 
762 aa  240  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  29.99 
 
 
805 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  40.94 
 
 
380 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  40.94 
 
 
380 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
764 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 
859 aa  230  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.59 
 
 
783 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  31.14 
 
 
868 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.584678 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  31.47 
 
 
737 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  28.44 
 
 
743 aa  228  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  27.9 
 
 
733 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 
790 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  28.28 
 
 
772 aa  225  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.64 
 
 
745 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 
772 aa  224  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>