More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4171 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  94.4 
 
 
733 aa  1358    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  99.86 
 
 
733 aa  1495    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  72.17 
 
 
922 aa  1080    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  96.59 
 
 
733 aa  1414    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  74.36 
 
 
731 aa  1080    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  100 
 
 
733 aa  1498    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  93.44 
 
 
733 aa  1332    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  94.26 
 
 
733 aa  1355    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  100 
 
 
733 aa  1498    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  71.9 
 
 
731 aa  1072    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  74.23 
 
 
549 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  48.96 
 
 
748 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  49.79 
 
 
751 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  49.51 
 
 
751 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  49.44 
 
 
779 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  49.51 
 
 
751 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1910  putative beta-glucosidase  69.71 
 
 
375 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1703  putative beta-glucosidase  69.44 
 
 
375 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.821899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  43.35 
 
 
731 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  73.64 
 
 
380 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  73.64 
 
 
380 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  42.86 
 
 
748 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  42.66 
 
 
748 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  42.82 
 
 
730 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  41.06 
 
 
735 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  41.94 
 
 
737 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  38.7 
 
 
931 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  41.48 
 
 
691 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2328  beta-glucosidase  68.67 
 
 
302 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.660208  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  37.54 
 
 
731 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.67 
 
 
755 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  35.75 
 
 
755 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.85 
 
 
749 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.85 
 
 
758 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  34.58 
 
 
829 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.45 
 
 
933 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.59 
 
 
987 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.49 
 
 
1158 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.22 
 
 
1072 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.43 
 
 
757 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  33.84 
 
 
721 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  33.05 
 
 
762 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  38.91 
 
 
693 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  33.94 
 
 
745 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.79 
 
 
1321 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.7 
 
 
734 aa  363  8e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38 
 
 
750 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 
711 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.48 
 
 
737 aa  352  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.56 
 
 
757 aa  350  4e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  34.08 
 
 
800 aa  350  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  34.86 
 
 
716 aa  349  8e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.84 
 
 
1338 aa  349  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  35.61 
 
 
749 aa  347  7e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.82 
 
 
790 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  33.91 
 
 
741 aa  342  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  34.97 
 
 
738 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  32.83 
 
 
717 aa  337  3.9999999999999995e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.63 
 
 
746 aa  333  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  34.02 
 
 
708 aa  330  4e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  32.02 
 
 
814 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35.55 
 
 
750 aa  330  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  33.47 
 
 
757 aa  330  7e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  31.86 
 
 
747 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 
813 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.56 
 
 
742 aa  326  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  31.91 
 
 
685 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  32.61 
 
 
721 aa  324  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  33.1 
 
 
714 aa  323  6e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.28 
 
 
760 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  31.95 
 
 
793 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  31.95 
 
 
793 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  36.33 
 
 
740 aa  320  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  34.6 
 
 
701 aa  319  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.51 
 
 
780 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  32.66 
 
 
722 aa  317  5e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.47 
 
 
737 aa  314  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.32 
 
 
758 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 
805 aa  310  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.83 
 
 
777 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  36.6 
 
 
737 aa  297  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.07 
 
 
751 aa  297  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  31.91 
 
 
822 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  31.34 
 
 
819 aa  293  6e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  32.45 
 
 
772 aa  293  8e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 
762 aa  293  9e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  31.22 
 
 
874 aa  292  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.86 
 
 
809 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.98 
 
 
748 aa  290  9e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.48 
 
 
771 aa  290  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.07 
 
 
756 aa  287  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.44 
 
 
724 aa  278  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  33.83 
 
 
790 aa  277  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.42 
 
 
782 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.01 
 
 
777 aa  270  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04102  beta-glucosidase (Eurofung)  34.19 
 
 
854 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  30.34 
 
 
905 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  31.53 
 
 
772 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.25 
 
 
798 aa  254  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.65 
 
 
778 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>