More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3845 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.66 
 
 		 1072 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.23 
 
 		 1158 aa  1031    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  100 
 
 		 987 aa  1971    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.27 
 
 		 1321 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  54.76 
 
 		 1338 aa  778    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  62.03 
 
 		 933 aa  823    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  46.46 
 
 		 693 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  38.42 
 
 		 731 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.82 
 
 		 755 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  39.21 
 
 		 762 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 		 758 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 		 749 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  38.51 
 
 		 755 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  37.15 
 
 		 745 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.61 
 
 		 734 aa  430  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.69 
 
 		 738 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  41.38 
 
 		 779 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  38.48 
 
 		 733 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  38.63 
 
 		 733 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  38.63 
 
 		 733 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  38.67 
 
 		 800 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.27 
 
 		 757 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  36.75 
 
 		 731 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  40.66 
 
 		 748 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  38.39 
 
 		 733 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  40.37 
 
 		 751 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  40.23 
 
 		 751 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  40.23 
 
 		 751 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.31 
 
 		 790 aa  419  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  38.81 
 
 		 748 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  38.58 
 
 		 760 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  39.72 
 
 		 740 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  37.57 
 
 		 733 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  36.04 
 
 		 922 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  36.89 
 
 		 733 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  37.61 
 
 		 733 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  36.04 
 
 		 731 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  36.78 
 
 		 747 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.55 
 
 		 737 aa  404  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.53 
 
 		 711 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  38.83 
 
 		 748 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  35 
 
 		 721 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.06 
 
 		 777 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.54 
 
 		 757 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  33.75 
 
 		 829 aa  396  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.88 
 
 		 750 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  38.16 
 
 		 730 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  37.99 
 
 		 750 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  39.73 
 
 		 737 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  37.29 
 
 		 741 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.22 
 
 		 758 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  36.93 
 
 		 757 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  36.03 
 
 		 749 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.47 
 
 		 742 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  37.97 
 
 		 737 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  36.07 
 
 		 735 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  36.78 
 
 		 931 aa  365  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.88 
 
 		 809 aa  362  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.28 
 
 		 737 aa  362  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 		 780 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  68.49 
 
 		 674 aa  358  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  36.22 
 
 		 691 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  35.06 
 
 		 819 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  65.37 
 
 		 962 aa  354  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  34 
 
 		 874 aa  353  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  33.2 
 
 		 721 aa  349  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  33.85 
 
 		 822 aa  348  4e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 		 685 aa  348  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.58 
 
 		 746 aa  347  6e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  33.52 
 
 		 793 aa  347  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  33.52 
 
 		 793 aa  346  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.61 
 
 		 751 aa  346  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.33 
 
 		 756 aa  344  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  33.1 
 
 		 716 aa  343  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  59.2 
 
 		 850 aa  341  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  32.92 
 
 		 722 aa  341  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  34.38 
 
 		 731 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  34.27 
 
 		 708 aa  339  9.999999999999999e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  32.28 
 
 		 717 aa  338  3.9999999999999995e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.85 
 
 		 748 aa  337  7e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 		 714 aa  334  5e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  58.71 
 
 		 578 aa  334  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.48 
 
 		 724 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  57.42 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  47.22 
 
 		 927 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  32.04 
 
 		 772 aa  326  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.42 
 
 		 813 aa  321  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  31.81 
 
 		 814 aa  318  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 		 743 aa  315  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  33.83 
 
 		 701 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.77 
 
 		 762 aa  310  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  71.15 
 
 		 815 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 		 764 aa  304  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  31.37 
 
 		 727 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.36 
 
 		 751 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 772 aa  296  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 		 805 aa  295  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.01 
 
 		 766 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.44 
 
 		 754 aa  290  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.24 
 
 		 782 aa  289  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>