172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3492 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  60.33 
 
 		 850 aa  698    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 962 aa  1925    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.22 
 
 		 722 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  53.1 
 
 		 918 aa  599  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  54.23 
 
 		 732 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.87 
 
 		 734 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.74 
 
 		 755 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  50.69 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.58 
 
 		 648 aa  522  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  48.43 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  48.19 
 
 		 627 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  47.75 
 
 		 844 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  50.89 
 
 		 562 aa  499  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  46.63 
 
 		 640 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  66.67 
 
 		 674 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  45.83 
 
 		 2117 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.92 
 
 		 537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  41.88 
 
 		 622 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.06 
 
 		 652 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  65.5 
 
 		 987 aa  360  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  69.8 
 
 		 1158 aa  340  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  58.09 
 
 		 581 aa  330  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  59.79 
 
 		 578 aa  319  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  35.11 
 
 		 726 aa  314  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  32.76 
 
 		 722 aa  303  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  72.31 
 
 		 815 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  52.35 
 
 		 588 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  49.65 
 
 		 752 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  44.6 
 
 		 4013 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  79.53 
 
 		 940 aa  220  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  44.75 
 
 		 1441 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  42.75 
 
 		 1581 aa  210  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.27 
 
 		 1564 aa  197  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  75 
 
 		 1007 aa  197  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.22 
 
 		 915 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  60.23 
 
 		 433 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  43.43 
 
 		 1028 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  55.36 
 
 		 571 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  66.43 
 
 		 449 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.11 
 
 		 1362 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  78.05 
 
 		 639 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  69.78 
 
 		 999 aa  168  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  39.85 
 
 		 578 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.73 
 
 		 756 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  50.37 
 
 		 637 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.56 
 
 		 953 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.48 
 
 		 1321 aa  141  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  57.14 
 
 		 452 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  53.17 
 
 		 392 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.69 
 
 		 929 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  57.03 
 
 		 801 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  26.93 
 
 		 1471 aa  138  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.59 
 
 		 819 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  48.23 
 
 		 1070 aa  132  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.62 
 
 		 729 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  44.68 
 
 		 1338 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 1184 aa  127  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  51.54 
 
 		 1103 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  53.19 
 
 		 1059 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 		 971 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  42.38 
 
 		 1059 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  49.61 
 
 		 879 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  38.27 
 
 		 732 aa  118  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  37.79 
 
 		 558 aa  118  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.16 
 
 		 984 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  51.08 
 
 		 471 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  54.14 
 
 		 487 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  54.14 
 
 		 487 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 		 1332 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  68.13 
 
 		 622 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.38 
 
 		 480 aa  112  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.26 
 
 		 1448 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.16 
 
 		 1117 aa  108  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.55 
 
 		 472 aa  108  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.55 
 
 		 472 aa  108  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  51.45 
 
 		 470 aa  107  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.67 
 
 		 1139 aa  105  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  53.44 
 
 		 475 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.28 
 
 		 695 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.28 
 
 		 470 aa  97.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  54.21 
 
 		 1016 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.55 
 
 		 470 aa  95.1  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  70.24 
 
 		 494 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.59 
 
 		 1060 aa  91.3  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  57.89 
 
 		 726 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  28.01 
 
 		 768 aa  88.6  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.95 
 
 		 933 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  64.37 
 
 		 3244 aa  88.2  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.77 
 
 		 820 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  61.54 
 
 		 824 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.9 
 
 		 478 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.62 
 
 		 929 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  54.64 
 
 		 884 aa  82  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.02 
 
 		 1072 aa  82  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.51 
 
 		 722 aa  81.6  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  33.45 
 
 		 818 aa  81.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  58.82 
 
 		 1148 aa  79.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  39.55 
 
 		 2079 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  58.16 
 
 		 753 aa  77.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  59.52 
 
 		 672 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>