21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5709 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  85.18 
 
 		 726 aa  1288    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  1501    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  34.54 
 
 		 2117 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.19 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  39.3 
 
 		 850 aa  330  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.43 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.23 
 
 		 962 aa  311  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.38 
 
 		 648 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  35.68 
 
 		 918 aa  303  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  36.24 
 
 		 732 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  35.25 
 
 		 640 aa  302  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  36.4 
 
 		 627 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  33.94 
 
 		 640 aa  288  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.44 
 
 		 755 aa  274  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.11 
 
 		 722 aa  271  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  32.14 
 
 		 622 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.76 
 
 		 940 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  31.37 
 
 		 645 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.4 
 
 		 652 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  33.08 
 
 		 562 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  32.34 
 
 		 844 aa  251  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>