248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3060 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
820 aa  1667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.16 
 
 
584 aa  355  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.18 
 
 
593 aa  354  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  41.94 
 
 
525 aa  350  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.49 
 
 
515 aa  349  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  41.06 
 
 
558 aa  347  5e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.42 
 
 
816 aa  335  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.4 
 
 
528 aa  330  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.81 
 
 
533 aa  273  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.16 
 
 
553 aa  267  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 
500 aa  263  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.59 
 
 
489 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.76 
 
 
542 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 
772 aa  244  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  31.83 
 
 
795 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.65 
 
 
613 aa  242  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 
609 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.89 
 
 
655 aa  240  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.76 
 
 
530 aa  241  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  32.02 
 
 
777 aa  240  9e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 
533 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
762 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.73 
 
 
774 aa  234  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.31 
 
 
790 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  31.21 
 
 
639 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.71 
 
 
618 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.68 
 
 
473 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.1 
 
 
549 aa  226  9e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 
795 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.99 
 
 
775 aa  224  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.74 
 
 
505 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.47 
 
 
605 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 
637 aa  221  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
779 aa  220  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.68 
 
 
905 aa  220  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  30.71 
 
 
639 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.06 
 
 
534 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.78 
 
 
546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.05 
 
 
634 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.64 
 
 
526 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
618 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.16 
 
 
547 aa  213  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  29.11 
 
 
776 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.76 
 
 
527 aa  211  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.24 
 
 
785 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 
821 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.41 
 
 
481 aa  208  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.82 
 
 
665 aa  208  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.53 
 
 
479 aa  207  8e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.81 
 
 
529 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.61 
 
 
781 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  30.74 
 
 
602 aa  200  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.48 
 
 
765 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.15 
 
 
779 aa  200  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.61 
 
 
812 aa  197  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 
766 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.49 
 
 
760 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.89 
 
 
812 aa  196  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  32.14 
 
 
736 aa  193  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 
534 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.08 
 
 
834 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.86 
 
 
469 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.24 
 
 
613 aa  190  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 
525 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.39 
 
 
549 aa  178  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.34 
 
 
852 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.32 
 
 
614 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
636 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.62 
 
 
688 aa  171  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.53 
 
 
636 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.18 
 
 
627 aa  167  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.28 
 
 
628 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.55 
 
 
545 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.67 
 
 
493 aa  166  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.53 
 
 
422 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.97 
 
 
688 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.43 
 
 
673 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.55 
 
 
910 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.04 
 
 
913 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  31.35 
 
 
543 aa  161  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 
447 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.25 
 
 
794 aa  160  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.73 
 
 
639 aa  160  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.43 
 
 
913 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.76 
 
 
858 aa  158  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 
915 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.41 
 
 
504 aa  156  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.66 
 
 
673 aa  157  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.35 
 
 
683 aa  151  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.34 
 
 
518 aa  150  9e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  27.98 
 
 
639 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.22 
 
 
857 aa  146  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 
797 aa  144  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.14 
 
 
676 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  27.22 
 
 
889 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.33 
 
 
863 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  31.87 
 
 
1140 aa  143  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.21 
 
 
853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.84 
 
 
868 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  29.92 
 
 
883 aa  141  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>