More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1396 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 1140 aa  2249    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.97 
 
 		 683 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.96 
 
 		 676 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  54.5 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.94 
 
 		 688 aa  377  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  50.51 
 
 		 407 aa  366  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  48.12 
 
 		 429 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  48.37 
 
 		 429 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.03 
 
 		 688 aa  319  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  39.67 
 
 		 438 aa  309  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.87 
 
 		 811 aa  281  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  36.79 
 
 		 429 aa  281  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.47 
 
 		 797 aa  273  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  35.77 
 
 		 807 aa  269  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.56 
 
 		 794 aa  265  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  39.1 
 
 		 406 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  38.46 
 
 		 429 aa  254  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  37.47 
 
 		 419 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  40.15 
 
 		 408 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  38.84 
 
 		 413 aa  245  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.5 
 
 		 605 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.69 
 
 		 821 aa  244  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  39.64 
 
 		 430 aa  244  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.35 
 
 		 781 aa  241  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.71 
 
 		 775 aa  240  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.06 
 
 		 778 aa  238  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.59 
 
 		 655 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.34 
 
 		 785 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.32 
 
 		 438 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.38 
 
 		 779 aa  234  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  34.23 
 
 		 736 aa  232  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  30.07 
 
 		 777 aa  231  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.3 
 
 		 812 aa  231  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  35.71 
 
 		 431 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.53 
 
 		 812 aa  229  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  36.36 
 
 		 426 aa  228  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  35.86 
 
 		 446 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.67 
 
 		 553 aa  228  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  34.94 
 
 		 437 aa  227  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.39 
 
 		 443 aa  226  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.42 
 
 		 772 aa  225  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.08 
 
 		 618 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.88 
 
 		 618 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  32.94 
 
 		 440 aa  222  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.62 
 
 		 774 aa  222  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 		 665 aa  221  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.51 
 
 		 613 aa  221  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 		 795 aa  221  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  33.42 
 
 		 441 aa  220  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.12 
 
 		 534 aa  220  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.3 
 
 		 547 aa  220  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  33.58 
 
 		 444 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  28.49 
 
 		 639 aa  219  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.96 
 
 		 549 aa  218  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.68 
 
 		 527 aa  218  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  29.19 
 
 		 639 aa  217  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.51 
 
 		 542 aa  217  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.44 
 
 		 609 aa  216  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  27.07 
 
 		 776 aa  215  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  30.71 
 
 		 637 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  34 
 
 		 452 aa  214  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  34 
 
 		 452 aa  214  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.83 
 
 		 526 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 		 790 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.71 
 
 		 441 aa  213  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.9 
 
 		 762 aa  212  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.3 
 
 		 760 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.29 
 
 		 765 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.62 
 
 		 905 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 		 533 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.14 
 
 		 505 aa  209  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  29.93 
 
 		 795 aa  209  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.53 
 
 		 469 aa  207  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 		 529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  31.16 
 
 		 602 aa  201  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 452 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.13 
 
 		 779 aa  198  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.32 
 
 		 613 aa  197  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.58 
 
 		 422 aa  197  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.61 
 
 		 546 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  34.71 
 
 		 433 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.5 
 
 		 834 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.13 
 
 		 766 aa  194  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  33.88 
 
 		 432 aa  193  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.79 
 
 		 515 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 		 634 aa  191  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.37 
 
 		 481 aa  191  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  33.49 
 
 		 435 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 		 525 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.35 
 
 		 545 aa  189  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 433 aa  188  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 432 aa  189  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 		 558 aa  188  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 432 aa  188  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  32.94 
 
 		 432 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.08 
 
 		 500 aa  187  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.93 
 
 		 636 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  32.94 
 
 		 432 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 435 aa  186  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.29 
 
 		 584 aa  185  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>