175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7198 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
525 aa  1051    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.26 
 
 
553 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.88 
 
 
534 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.66 
 
 
526 aa  365  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.08 
 
 
762 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.99 
 
 
542 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.43 
 
 
527 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.12 
 
 
546 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.43 
 
 
534 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.35 
 
 
505 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  43.67 
 
 
469 aa  340  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  38 
 
 
795 aa  337  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.32 
 
 
422 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.76 
 
 
790 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  41.03 
 
 
543 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.29 
 
 
609 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
613 aa  310  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.91 
 
 
775 aa  309  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
772 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.75 
 
 
766 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 
533 aa  303  7.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.12 
 
 
785 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.35 
 
 
618 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.03 
 
 
821 aa  300  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.67 
 
 
605 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.96 
 
 
545 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
613 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  38.25 
 
 
736 aa  293  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.71 
 
 
634 aa  289  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.82 
 
 
779 aa  288  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  32.39 
 
 
795 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.95 
 
 
781 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  41.21 
 
 
614 aa  287  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  35.52 
 
 
777 aa  285  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.11 
 
 
628 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 
774 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 
905 aa  282  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.41 
 
 
812 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.86 
 
 
812 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  34.05 
 
 
776 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 
655 aa  280  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.74 
 
 
618 aa  280  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.34 
 
 
549 aa  278  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 
760 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.27 
 
 
665 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.04 
 
 
447 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.74 
 
 
765 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.85 
 
 
547 aa  247  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.21 
 
 
834 aa  247  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
637 aa  243  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.45 
 
 
481 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.37 
 
 
779 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  32.3 
 
 
639 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  32.3 
 
 
639 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  31.56 
 
 
602 aa  231  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.9 
 
 
558 aa  226  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 
504 aa  225  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.43 
 
 
515 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.84 
 
 
525 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.37 
 
 
529 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 
584 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
493 aa  218  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
528 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
593 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.45 
 
 
518 aa  209  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  32.2 
 
 
639 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
636 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.15 
 
 
500 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.31 
 
 
816 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.6 
 
 
858 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.48 
 
 
636 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.69 
 
 
627 aa  199  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 
549 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.81 
 
 
688 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 
688 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.8 
 
 
913 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  33.4 
 
 
1140 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 
639 aa  190  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.32 
 
 
913 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.59 
 
 
811 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 
820 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 
910 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
915 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
489 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.21 
 
 
852 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.25 
 
 
530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.24 
 
 
683 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.02 
 
 
797 aa  180  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  27.75 
 
 
896 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.32 
 
 
673 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.16 
 
 
857 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.29 
 
 
866 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.65 
 
 
794 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.15 
 
 
853 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.03 
 
 
888 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  28.63 
 
 
833 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  28.43 
 
 
833 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  28.43 
 
 
833 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  28.43 
 
 
856 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>