175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9002 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  69.22 
 
 
543 aa  723    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
545 aa  1078    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.17 
 
 
526 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.12 
 
 
505 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.03 
 
 
546 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.21 
 
 
534 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.41 
 
 
534 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.67 
 
 
553 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.92 
 
 
527 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.22 
 
 
790 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 
542 aa  333  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.1 
 
 
762 aa  327  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.83 
 
 
628 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.38 
 
 
795 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  45.24 
 
 
614 aa  321  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.32 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  40.18 
 
 
469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 
905 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.97 
 
 
779 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.13 
 
 
605 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.17 
 
 
618 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.58 
 
 
609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.91 
 
 
613 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.96 
 
 
525 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.62 
 
 
549 aa  295  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.75 
 
 
781 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  34.24 
 
 
795 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.86 
 
 
785 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 
634 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.92 
 
 
422 aa  290  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  39.67 
 
 
736 aa  290  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 
613 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.63 
 
 
772 aa  286  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.94 
 
 
821 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.34 
 
 
812 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  36.41 
 
 
776 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  34.1 
 
 
777 aa  279  7e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.9 
 
 
812 aa  280  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 
775 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 
774 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 
765 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
766 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.17 
 
 
655 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.1 
 
 
760 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.69 
 
 
533 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.98 
 
 
779 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  31.84 
 
 
639 aa  253  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  31.45 
 
 
639 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
549 aa  247  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
618 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.01 
 
 
529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.28 
 
 
665 aa  245  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.08 
 
 
602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.14 
 
 
834 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34 
 
 
639 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.4 
 
 
688 aa  223  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.15 
 
 
858 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.34 
 
 
688 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
481 aa  219  8.999999999999998e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  29.62 
 
 
637 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.5 
 
 
636 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.67 
 
 
866 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 
493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 
547 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.69 
 
 
504 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
639 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.55 
 
 
794 aa  204  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.7 
 
 
636 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.38 
 
 
797 aa  200  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.89 
 
 
525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.51 
 
 
683 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.64 
 
 
627 aa  196  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.35 
 
 
593 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.31 
 
 
518 aa  193  7e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.58 
 
 
584 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.43 
 
 
558 aa  192  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.44 
 
 
868 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.65 
 
 
852 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.18 
 
 
816 aa  190  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  34.35 
 
 
1140 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.82 
 
 
515 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.95 
 
 
811 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  30.19 
 
 
896 aa  180  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.82 
 
 
528 aa  180  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.21 
 
 
863 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.66 
 
 
676 aa  173  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.09 
 
 
673 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  29.24 
 
 
889 aa  170  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.06 
 
 
853 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.55 
 
 
820 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.61 
 
 
807 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
888 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.79 
 
 
673 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.71 
 
 
900 aa  161  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.94 
 
 
896 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 
913 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.85 
 
 
533 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
896 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.92 
 
 
778 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.44 
 
 
884 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>