175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0536 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  65.19 
 
 
794 aa  1080    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
797 aa  1620    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.37 
 
 
811 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  41.34 
 
 
807 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  41.94 
 
 
778 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.51 
 
 
683 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.21 
 
 
688 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.07 
 
 
676 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.44 
 
 
688 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  41.27 
 
 
1140 aa  273  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 
613 aa  264  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.52 
 
 
785 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.95 
 
 
618 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.61 
 
 
762 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  33.56 
 
 
777 aa  253  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  30.77 
 
 
795 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.49 
 
 
821 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.4 
 
 
542 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.44 
 
 
781 aa  250  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.21 
 
 
790 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.87 
 
 
609 aa  243  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.55 
 
 
634 aa  240  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.19 
 
 
553 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  40 
 
 
736 aa  238  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.6 
 
 
905 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.79 
 
 
774 aa  237  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.53 
 
 
549 aa  236  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 
655 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.51 
 
 
526 aa  231  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.99 
 
 
779 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.77 
 
 
812 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.26 
 
 
613 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.14 
 
 
812 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.78 
 
 
834 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  33.9 
 
 
602 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.91 
 
 
505 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 
637 aa  219  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 
795 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.31 
 
 
766 aa  218  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.8 
 
 
775 aa  217  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  31.12 
 
 
776 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.96 
 
 
533 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.44 
 
 
605 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.38 
 
 
469 aa  214  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.15 
 
 
534 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
665 aa  210  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.62 
 
 
527 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  29.33 
 
 
639 aa  209  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.33 
 
 
779 aa  208  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.83 
 
 
546 aa  208  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.22 
 
 
636 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 
765 aa  207  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.67 
 
 
618 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  29.67 
 
 
639 aa  205  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.44 
 
 
772 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.82 
 
 
534 aa  203  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.38 
 
 
545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.83 
 
 
481 aa  197  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.47 
 
 
627 aa  196  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 
529 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  35.65 
 
 
543 aa  196  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  35.9 
 
 
614 aa  196  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  31.05 
 
 
639 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.13 
 
 
422 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.16 
 
 
760 aa  194  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.68 
 
 
558 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  36 
 
 
493 aa  192  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.63 
 
 
504 aa  192  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.63 
 
 
636 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.99 
 
 
547 aa  190  8e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 
515 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.8 
 
 
584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  33.85 
 
 
603 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.93 
 
 
639 aa  183  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.02 
 
 
525 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.93 
 
 
549 aa  179  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.04 
 
 
593 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.28 
 
 
518 aa  169  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.16 
 
 
614 aa  167  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.13 
 
 
858 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.11 
 
 
447 aa  163  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.8 
 
 
500 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.84 
 
 
525 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 
673 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.49 
 
 
816 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49563  predicted protein  33.43 
 
 
973 aa  154  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.61 
 
 
528 aa  154  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.67 
 
 
489 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.58 
 
 
866 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.06 
 
 
673 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.3 
 
 
533 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.68 
 
 
628 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 
820 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 
853 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.31 
 
 
885 aa  141  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.11 
 
 
852 aa  141  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.43 
 
 
479 aa  140  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  33.88 
 
 
503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  26.79 
 
 
891 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.79 
 
 
891 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>