175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4989 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
534 aa  1074    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.51 
 
 
526 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.73 
 
 
505 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.99 
 
 
628 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  51.08 
 
 
614 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.49 
 
 
553 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.42 
 
 
542 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.32 
 
 
447 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.25 
 
 
527 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.86 
 
 
534 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.88 
 
 
762 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.12 
 
 
772 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.38 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.21 
 
 
609 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.15 
 
 
795 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.77 
 
 
613 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.94 
 
 
785 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.58 
 
 
618 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.82 
 
 
790 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  45.3 
 
 
543 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.47 
 
 
775 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.09 
 
 
779 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.39 
 
 
781 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  45.89 
 
 
736 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.04 
 
 
821 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.01 
 
 
774 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.57 
 
 
905 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.45 
 
 
605 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.61 
 
 
533 aa  364  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  39.13 
 
 
777 aa  361  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  37.77 
 
 
795 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.21 
 
 
545 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.14 
 
 
634 aa  355  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.33 
 
 
613 aa  355  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.46 
 
 
766 aa  354  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  36.48 
 
 
776 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.88 
 
 
812 aa  349  8e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.44 
 
 
422 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.84 
 
 
812 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  42.69 
 
 
469 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.43 
 
 
525 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.72 
 
 
549 aa  340  5e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.82 
 
 
760 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.71 
 
 
765 aa  333  7.000000000000001e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.38 
 
 
655 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.22 
 
 
779 aa  327  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.05 
 
 
665 aa  325  9e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.68 
 
 
618 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.84 
 
 
834 aa  306  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  36.13 
 
 
639 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  37.08 
 
 
602 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  35.6 
 
 
639 aa  296  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 
637 aa  294  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.73 
 
 
547 aa  294  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.76 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.33 
 
 
549 aa  279  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.34 
 
 
515 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.29 
 
 
529 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.49 
 
 
639 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.81 
 
 
816 aa  266  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  39.21 
 
 
639 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.13 
 
 
525 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 
636 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.85 
 
 
636 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.99 
 
 
627 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.51 
 
 
688 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.53 
 
 
493 aa  244  3e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  34.1 
 
 
558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
688 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.93 
 
 
858 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.73 
 
 
593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.81 
 
 
528 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.33 
 
 
584 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.84 
 
 
683 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
673 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 
504 aa  229  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.96 
 
 
794 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.12 
 
 
820 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  35.12 
 
 
1140 aa  219  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.97 
 
 
673 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.27 
 
 
500 aa  217  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.38 
 
 
866 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.84 
 
 
676 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.31 
 
 
489 aa  213  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.15 
 
 
797 aa  213  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.07 
 
 
811 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.31 
 
 
852 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.18 
 
 
518 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.75 
 
 
533 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.87 
 
 
863 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  33.13 
 
 
807 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.25 
 
 
530 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.67 
 
 
868 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.06 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
853 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.48 
 
 
778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.54 
 
 
473 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 
884 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.21 
 
 
913 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.21 
 
 
888 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>