174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1293 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
534 aa  1050    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.81 
 
 
546 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.51 
 
 
526 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.58 
 
 
527 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.24 
 
 
534 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.91 
 
 
553 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.7 
 
 
762 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.32 
 
 
542 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.08 
 
 
790 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  48.85 
 
 
614 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.99 
 
 
505 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  43.94 
 
 
543 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.73 
 
 
618 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  37.16 
 
 
795 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  46.71 
 
 
469 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.1 
 
 
775 aa  376  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.11 
 
 
545 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.59 
 
 
533 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.02 
 
 
525 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.2 
 
 
795 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 
766 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.65 
 
 
613 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.83 
 
 
609 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.67 
 
 
634 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 
772 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.48 
 
 
605 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  37.69 
 
 
776 aa  347  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.98 
 
 
549 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  41.52 
 
 
736 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.44 
 
 
628 aa  343  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.85 
 
 
905 aa  339  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.56 
 
 
821 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.38 
 
 
779 aa  338  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.29 
 
 
774 aa  336  5e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.13 
 
 
785 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.61 
 
 
422 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.09 
 
 
781 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  36.09 
 
 
777 aa  329  6e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.96 
 
 
613 aa  326  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.27 
 
 
447 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  35.88 
 
 
639 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 
812 aa  318  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  35.5 
 
 
639 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.73 
 
 
760 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.99 
 
 
812 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.89 
 
 
765 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.74 
 
 
618 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.14 
 
 
779 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.15 
 
 
655 aa  300  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 
834 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.64 
 
 
637 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.54 
 
 
665 aa  273  8.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  39 
 
 
627 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.51 
 
 
602 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.02 
 
 
515 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.72 
 
 
481 aa  254  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.08 
 
 
816 aa  250  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  41.3 
 
 
639 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.61 
 
 
639 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.85 
 
 
549 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  35.43 
 
 
558 aa  248  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.74 
 
 
636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.93 
 
 
636 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.73 
 
 
547 aa  236  6e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.41 
 
 
529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.97 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.74 
 
 
489 aa  231  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.74 
 
 
504 aa  226  8e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.68 
 
 
525 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.49 
 
 
584 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.87 
 
 
688 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.42 
 
 
688 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 
683 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.44 
 
 
533 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.85 
 
 
500 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 
811 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.29 
 
 
518 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.51 
 
 
528 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.79 
 
 
797 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.97 
 
 
858 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.42 
 
 
673 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.21 
 
 
794 aa  203  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.92 
 
 
593 aa  203  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.53 
 
 
673 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 
820 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.84 
 
 
852 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  32.08 
 
 
1140 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.93 
 
 
866 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  28.66 
 
 
896 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
896 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.29 
 
 
896 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.9 
 
 
863 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.01 
 
 
807 aa  177  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.94 
 
 
473 aa  176  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.86 
 
 
530 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.49 
 
 
868 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.36 
 
 
676 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  28.33 
 
 
935 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.52 
 
 
888 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.51 
 
 
853 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>