183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2039 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.86 
 
 
774 aa  739    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
772 aa  1601    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.75 
 
 
762 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.91 
 
 
618 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.89 
 
 
795 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.35 
 
 
613 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.48 
 
 
605 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.37 
 
 
553 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  35.25 
 
 
795 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 
775 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  34.23 
 
 
776 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.3 
 
 
779 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.97 
 
 
905 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.54 
 
 
533 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.24 
 
 
526 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.03 
 
 
618 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  40 
 
 
777 aa  437  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.67 
 
 
542 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.98 
 
 
613 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.92 
 
 
609 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.59 
 
 
765 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.4 
 
 
655 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.3 
 
 
634 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.03 
 
 
766 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.47 
 
 
781 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  38.09 
 
 
736 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.39 
 
 
821 aa  402  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.71 
 
 
790 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.12 
 
 
534 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.42 
 
 
812 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.97 
 
 
812 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
785 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.82 
 
 
760 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.72 
 
 
505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.17 
 
 
549 aa  355  1e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.63 
 
 
779 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.43 
 
 
834 aa  351  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.84 
 
 
527 aa  350  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 
534 aa  344  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.16 
 
 
546 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  38.24 
 
 
469 aa  319  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.12 
 
 
665 aa  312  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.9 
 
 
549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
525 aa  306  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
637 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.01 
 
 
639 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.89 
 
 
422 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.4 
 
 
639 aa  300  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.95 
 
 
636 aa  294  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.8 
 
 
628 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.84 
 
 
614 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.63 
 
 
545 aa  286  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
543 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.4 
 
 
547 aa  278  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.72 
 
 
602 aa  274  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.51 
 
 
481 aa  272  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.51 
 
 
636 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 
447 aa  269  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.83 
 
 
529 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.87 
 
 
558 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.17 
 
 
584 aa  267  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
639 aa  262  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.66 
 
 
688 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.8 
 
 
593 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  35.54 
 
 
525 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 
688 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.47 
 
 
639 aa  257  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.69 
 
 
515 aa  250  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 
627 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.83 
 
 
528 aa  247  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.7 
 
 
683 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 
493 aa  245  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 
820 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.78 
 
 
533 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.62 
 
 
816 aa  241  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.31 
 
 
504 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.07 
 
 
676 aa  231  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.86 
 
 
673 aa  227  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.29 
 
 
794 aa  226  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  28.42 
 
 
1140 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.39 
 
 
673 aa  221  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 
518 aa  214  5.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.99 
 
 
858 aa  211  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.11 
 
 
500 aa  205  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  35.44 
 
 
807 aa  204  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.25 
 
 
852 aa  203  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.85 
 
 
797 aa  203  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.55 
 
 
778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.52 
 
 
863 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.37 
 
 
811 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  27.91 
 
 
896 aa  194  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.13 
 
 
866 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.52 
 
 
884 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  28.97 
 
 
889 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 
530 aa  191  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.22 
 
 
868 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  27.94 
 
 
881 aa  191  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  28.94 
 
 
883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.66 
 
 
900 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.44 
 
 
489 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>