187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1350 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.78 
 
 		 779 aa  747    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 775 aa  1598    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.95 
 
 		 762 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.1 
 
 		 795 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.64 
 
 		 766 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.56 
 
 		 618 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.25 
 
 		 790 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.44 
 
 		 613 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.81 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.73 
 
 		 905 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.41 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.68 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  41.88 
 
 		 777 aa  465  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  37.58 
 
 		 776 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  35.86 
 
 		 795 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.64 
 
 		 774 aa  462  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 		 772 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.22 
 
 		 542 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.43 
 
 		 613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.12 
 
 		 634 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.39 
 
 		 526 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.1 
 
 		 618 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.62 
 
 		 765 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.23 
 
 		 821 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  38.71 
 
 		 736 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.92 
 
 		 785 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.65 
 
 		 605 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.83 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.47 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.91 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.94 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.67 
 
 		 760 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.31 
 
 		 812 aa  369  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.86 
 
 		 812 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.2 
 
 		 781 aa  360  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.49 
 
 		 779 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.53 
 
 		 549 aa  351  3e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.93 
 
 		 655 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.12 
 
 		 505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  41.06 
 
 		 469 aa  336  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.58 
 
 		 834 aa  335  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  35.06 
 
 		 639 aa  320  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  36.97 
 
 		 639 aa  310  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.91 
 
 		 525 aa  309  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  35.6 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.01 
 
 		 665 aa  306  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.42 
 
 		 547 aa  306  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.04 
 
 		 529 aa  297  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.44 
 
 		 422 aa  297  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.91 
 
 		 614 aa  293  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 		 543 aa  293  9e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.53 
 
 		 481 aa  293  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.7 
 
 		 549 aa  292  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.93 
 
 		 628 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  34.36 
 
 		 602 aa  291  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 		 683 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.89 
 
 		 688 aa  277  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 		 447 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.3 
 
 		 636 aa  273  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.18 
 
 		 636 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 		 627 aa  267  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.85 
 
 		 639 aa  263  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.36 
 
 		 858 aa  262  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  35.36 
 
 		 639 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 		 593 aa  257  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.27 
 
 		 525 aa  256  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.09 
 
 		 584 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 		 673 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.14 
 
 		 688 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.12 
 
 		 515 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.06 
 
 		 558 aa  248  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.09 
 
 		 673 aa  247  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.55 
 
 		 863 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.3 
 
 		 816 aa  239  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 		 533 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.7 
 
 		 676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.01 
 
 		 807 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.77 
 
 		 493 aa  227  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.85 
 
 		 1140 aa  226  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.13 
 
 		 811 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.98 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.99 
 
 		 820 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.25 
 
 		 852 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 		 868 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.36 
 
 		 794 aa  218  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.24 
 
 		 778 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.76 
 
 		 504 aa  216  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.95 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 		 797 aa  213  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 		 866 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.09 
 
 		 518 aa  206  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.87 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.5 
 
 		 913 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.26 
 
 		 857 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.52 
 
 		 884 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 		 915 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.77 
 
 		 910 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  32.41 
 
 		 889 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.33 
 
 		 913 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>