187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1198 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
774 aa  1616    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.86 
 
 
772 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.05 
 
 
762 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.13 
 
 
618 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.09 
 
 
613 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.72 
 
 
795 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.64 
 
 
775 aa  462  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.53 
 
 
553 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.64 
 
 
779 aa  448  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  42.88 
 
 
777 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.66 
 
 
605 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.74 
 
 
905 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.85 
 
 
542 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.67 
 
 
618 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  34.72 
 
 
776 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.56 
 
 
609 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  33.72 
 
 
795 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.5 
 
 
613 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.64 
 
 
533 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.15 
 
 
821 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.4 
 
 
634 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.73 
 
 
766 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.92 
 
 
526 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.04 
 
 
765 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.25 
 
 
655 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.73 
 
 
781 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  38.07 
 
 
736 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
790 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.01 
 
 
534 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.31 
 
 
760 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.74 
 
 
779 aa  360  7e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.44 
 
 
812 aa  359  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.78 
 
 
812 aa  351  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.33 
 
 
527 aa  348  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.37 
 
 
549 aa  345  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.25 
 
 
785 aa  343  7e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.22 
 
 
534 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.43 
 
 
834 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.8 
 
 
469 aa  330  6e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.03 
 
 
665 aa  321  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.92 
 
 
505 aa  320  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.04 
 
 
546 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.9 
 
 
549 aa  303  8.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.67 
 
 
529 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.95 
 
 
547 aa  295  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.1 
 
 
637 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  32.89 
 
 
639 aa  290  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.65 
 
 
639 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  33.2 
 
 
602 aa  283  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 
525 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.41 
 
 
614 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 
545 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 
543 aa  278  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 
636 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.81 
 
 
422 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.97 
 
 
447 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.84 
 
 
628 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.08 
 
 
627 aa  266  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.96 
 
 
688 aa  263  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
636 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.22 
 
 
481 aa  259  9e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.17 
 
 
683 aa  257  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 
688 aa  257  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  36.32 
 
 
639 aa  256  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.46 
 
 
858 aa  254  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.64 
 
 
816 aa  251  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  31.05 
 
 
558 aa  250  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.9 
 
 
639 aa  242  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.09 
 
 
852 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.47 
 
 
593 aa  242  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.35 
 
 
493 aa  241  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.79 
 
 
797 aa  237  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.21 
 
 
525 aa  236  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.73 
 
 
820 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.09 
 
 
584 aa  234  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.28 
 
 
673 aa  234  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 
866 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.86 
 
 
794 aa  230  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.15 
 
 
504 aa  230  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 
673 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.7 
 
 
676 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.74 
 
 
863 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.62 
 
 
1140 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.65 
 
 
533 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.7 
 
 
518 aa  213  9e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.93 
 
 
868 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
807 aa  210  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.88 
 
 
811 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 
515 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.71 
 
 
528 aa  207  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.2 
 
 
884 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.94 
 
 
778 aa  197  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 
857 aa  194  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  30.54 
 
 
896 aa  188  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
500 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.07 
 
 
530 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  26.51 
 
 
883 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  29.2 
 
 
889 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  26.38 
 
 
883 aa  178  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.31 
 
 
853 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>