175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3430 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 584 aa  1145    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  82.8 
 
 		 593 aa  947    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  53.43 
 
 		 525 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.16 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  50.1 
 
 		 558 aa  475  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.31 
 
 		 528 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  46.2 
 
 		 816 aa  439  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.63 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.54 
 
 		 500 aa  361  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.16 
 
 		 820 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  44.84 
 
 		 473 aa  351  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.79 
 
 		 489 aa  349  9e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.17 
 
 		 530 aa  329  9e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.77 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.77 
 
 		 762 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.25 
 
 		 605 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.77 
 
 		 618 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.07 
 
 		 553 aa  274  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.94 
 
 		 795 aa  274  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  33.84 
 
 		 795 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.9 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.5 
 
 		 613 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.17 
 
 		 772 aa  267  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.78 
 
 		 655 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  35.35 
 
 		 777 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  32.44 
 
 		 776 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 		 618 aa  260  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 		 779 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.76 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.53 
 
 		 505 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.09 
 
 		 775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  30.57 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  32.91 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.59 
 
 		 779 aa  254  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 		 781 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.32 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.81 
 
 		 765 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.17 
 
 		 546 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.87 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  32.23 
 
 		 637 aa  248  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.07 
 
 		 609 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.59 
 
 		 665 aa  246  8e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.3 
 
 		 634 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.98 
 
 		 905 aa  243  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  36.18 
 
 		 736 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.08 
 
 		 760 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.02 
 
 		 785 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.44 
 
 		 834 aa  238  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.33 
 
 		 534 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.53 
 
 		 547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.09 
 
 		 774 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.43 
 
 		 527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  31.74 
 
 		 602 aa  233  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.17 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.73 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.58 
 
 		 613 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.33 
 
 		 812 aa  229  9e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.56 
 
 		 812 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.23 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 		 821 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.55 
 
 		 628 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.43 
 
 		 766 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 636 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.67 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.49 
 
 		 534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 		 639 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 		 493 aa  213  7e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  38.24 
 
 		 614 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.83 
 
 		 688 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.63 
 
 		 636 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  37.04 
 
 		 543 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 		 504 aa  210  7e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.41 
 
 		 469 aa  206  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.76 
 
 		 673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 		 852 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.52 
 
 		 688 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.55 
 
 		 639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.71 
 
 		 683 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.58 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.98 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.96 
 
 		 676 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.8 
 
 		 797 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  34.29 
 
 		 1140 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 		 673 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 		 866 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.94 
 
 		 627 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.77 
 
 		 858 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.9 
 
 		 863 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.44 
 
 		 868 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.05 
 
 		 518 aa  179  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.08 
 
 		 811 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.06 
 
 		 794 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  28.94 
 
 		 883 aa  170  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  28.34 
 
 		 883 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.01 
 
 		 857 aa  166  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  27.53 
 
 		 883 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  26.73 
 
 		 891 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.73 
 
 		 891 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>