180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1614 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
634 aa  1303    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.57 
 
 
905 aa  614  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.29 
 
 
766 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.5 
 
 
613 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.49 
 
 
762 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.61 
 
 
790 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.18 
 
 
609 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.73 
 
 
533 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.64 
 
 
553 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.55 
 
 
542 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.66 
 
 
795 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.32 
 
 
779 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  43.7 
 
 
777 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.77 
 
 
618 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.5 
 
 
613 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  40.91 
 
 
795 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.46 
 
 
775 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  38.59 
 
 
776 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.07 
 
 
772 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.54 
 
 
781 aa  422  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.09 
 
 
605 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.64 
 
 
526 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.39 
 
 
655 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.87 
 
 
779 aa  405  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.76 
 
 
785 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  41.39 
 
 
736 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.95 
 
 
618 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.77 
 
 
774 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.41 
 
 
812 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.51 
 
 
812 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.88 
 
 
549 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.02 
 
 
821 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.73 
 
 
765 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.26 
 
 
760 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.77 
 
 
834 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.16 
 
 
534 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.39 
 
 
505 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 
527 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.67 
 
 
534 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.61 
 
 
469 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.21 
 
 
546 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.1 
 
 
422 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.55 
 
 
628 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.55 
 
 
614 aa  306  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.84 
 
 
543 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  35.03 
 
 
602 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  35.25 
 
 
639 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.12 
 
 
549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 
545 aa  290  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.71 
 
 
525 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  35.78 
 
 
639 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.29 
 
 
637 aa  281  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 
547 aa  280  6e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.64 
 
 
665 aa  279  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.45 
 
 
529 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.98 
 
 
636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.41 
 
 
627 aa  274  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.17 
 
 
558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.58 
 
 
481 aa  263  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.98 
 
 
639 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 
683 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  32.16 
 
 
639 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.35 
 
 
858 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.26 
 
 
636 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.7 
 
 
447 aa  254  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.64 
 
 
515 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.9 
 
 
688 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.75 
 
 
688 aa  249  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.3 
 
 
584 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.98 
 
 
533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.56 
 
 
593 aa  244  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.79 
 
 
797 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.71 
 
 
816 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.59 
 
 
528 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.45 
 
 
493 aa  233  8.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.74 
 
 
794 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
807 aa  224  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.12 
 
 
525 aa  224  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
673 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.12 
 
 
852 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.56 
 
 
504 aa  220  7e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.55 
 
 
868 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.68 
 
 
863 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.79 
 
 
866 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
673 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.05 
 
 
820 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 
676 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.76 
 
 
489 aa  209  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.79 
 
 
811 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.84 
 
 
518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.7 
 
 
778 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
530 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  28.1 
 
 
1140 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.42 
 
 
857 aa  187  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.72 
 
 
853 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.26 
 
 
473 aa  183  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  28.88 
 
 
889 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.27 
 
 
884 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.93 
 
 
500 aa  178  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  26.34 
 
 
883 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>