194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4994 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 765 aa  1590    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.18 
 
 		 760 aa  888    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.58 
 
 		 618 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.75 
 
 		 790 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.94 
 
 		 613 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.52 
 
 		 795 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.85 
 
 		 766 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.59 
 
 		 772 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.9 
 
 		 762 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.02 
 
 		 605 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  37.32 
 
 		 795 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.62 
 
 		 775 aa  399  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.88 
 
 		 533 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  33.51 
 
 		 777 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.07 
 
 		 609 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.67 
 
 		 774 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.6 
 
 		 553 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.82 
 
 		 542 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.19 
 
 		 905 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.48 
 
 		 779 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.73 
 
 		 634 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.84 
 
 		 779 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.91 
 
 		 526 aa  364  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  36.78 
 
 		 736 aa  361  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.4 
 
 		 613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  35.34 
 
 		 776 aa  357  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 		 618 aa  350  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.25 
 
 		 781 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.11 
 
 		 655 aa  347  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.85 
 
 		 549 aa  343  5.999999999999999e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.01 
 
 		 527 aa  342  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.29 
 
 		 785 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 		 821 aa  338  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.71 
 
 		 534 aa  333  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.83 
 
 		 812 aa  331  3e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 		 812 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.24 
 
 		 546 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.12 
 
 		 505 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 		 534 aa  294  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.72 
 
 		 628 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.15 
 
 		 665 aa  290  5.0000000000000004e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 		 834 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.83 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  35.49 
 
 		 639 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.07 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  33.63 
 
 		 637 aa  278  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.63 
 
 		 469 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 		 545 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.85 
 
 		 547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  34 
 
 		 602 aa  271  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 		 593 aa  264  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.86 
 
 		 858 aa  257  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 		 422 aa  257  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 		 636 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.68 
 
 		 549 aa  254  5.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.64 
 
 		 481 aa  254  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.35 
 
 		 688 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 515 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.81 
 
 		 584 aa  251  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 		 636 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.74 
 
 		 525 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.92 
 
 		 816 aa  249  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.98 
 
 		 614 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.61 
 
 		 447 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.73 
 
 		 525 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  30.58 
 
 		 558 aa  242  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 		 688 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 		 627 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.32 
 
 		 533 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.83 
 
 		 683 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 		 639 aa  230  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.19 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  35.01 
 
 		 639 aa  228  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.68 
 
 		 673 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.44 
 
 		 807 aa  226  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 		 673 aa  220  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.16 
 
 		 794 aa  218  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.67 
 
 		 852 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.93 
 
 		 866 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  28.87 
 
 		 1140 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.48 
 
 		 500 aa  208  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.13 
 
 		 797 aa  206  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.53 
 
 		 493 aa  204  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.96 
 
 		 504 aa  204  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.87 
 
 		 676 aa  204  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.98 
 
 		 868 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.74 
 
 		 820 aa  200  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.63 
 
 		 518 aa  199  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  26.19 
 
 		 889 aa  198  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.78 
 
 		 863 aa  197  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.08 
 
 		 489 aa  195  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.09 
 
 		 857 aa  195  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 		 884 aa  195  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.23 
 
 		 811 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.83 
 
 		 915 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.37 
 
 		 913 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.91 
 
 		 778 aa  190  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.87 
 
 		 913 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.31 
 
 		 910 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>