176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03430 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  88.11 
 
 
639 aa  1213    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  63.38 
 
 
637 aa  877    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  100 
 
 
639 aa  1342    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  64.57 
 
 
602 aa  829    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34.82 
 
 
639 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.71 
 
 
639 aa  359  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.91 
 
 
834 aa  347  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.11 
 
 
605 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 
636 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.44 
 
 
636 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.29 
 
 
533 aa  331  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.24 
 
 
779 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.38 
 
 
627 aa  327  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.87 
 
 
766 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.14 
 
 
795 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.67 
 
 
553 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  36.84 
 
 
777 aa  322  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.9 
 
 
762 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.06 
 
 
775 aa  320  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.88 
 
 
534 aa  317  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.38 
 
 
673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.46 
 
 
790 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.6 
 
 
673 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.82 
 
 
526 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.59 
 
 
609 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.4 
 
 
618 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  37.47 
 
 
736 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.9 
 
 
905 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.26 
 
 
760 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.52 
 
 
613 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.88 
 
 
618 aa  306  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.04 
 
 
549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.39 
 
 
821 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
772 aa  303  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.13 
 
 
534 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.01 
 
 
785 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.96 
 
 
858 aa  299  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.73 
 
 
655 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 
529 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  34.6 
 
 
776 aa  297  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.97 
 
 
613 aa  297  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.53 
 
 
542 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  36.09 
 
 
795 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.2 
 
 
781 aa  294  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  36 
 
 
505 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.51 
 
 
469 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.25 
 
 
634 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 
774 aa  290  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.83 
 
 
765 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.82 
 
 
546 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.85 
 
 
779 aa  285  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.62 
 
 
812 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.98 
 
 
812 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.38 
 
 
527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.06 
 
 
481 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.05 
 
 
593 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.94 
 
 
866 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.33 
 
 
614 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
665 aa  260  6e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
547 aa  260  6e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.57 
 
 
584 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.84 
 
 
545 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  33.07 
 
 
896 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  32.76 
 
 
543 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
549 aa  251  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.3 
 
 
857 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 
515 aa  247  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.06 
 
 
852 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.33 
 
 
888 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 
900 aa  241  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.47 
 
 
888 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.33 
 
 
888 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 
447 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 
884 aa  238  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.56 
 
 
422 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.28 
 
 
896 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.13 
 
 
896 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.75 
 
 
906 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.3 
 
 
525 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 
489 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  32.28 
 
 
889 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.61 
 
 
525 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.4 
 
 
853 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  31.93 
 
 
558 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.2 
 
 
863 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.16 
 
 
628 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.1 
 
 
683 aa  230  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.21 
 
 
820 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 
913 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
500 aa  230  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.87 
 
 
688 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.9 
 
 
868 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.84 
 
 
816 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.03 
 
 
528 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.03 
 
 
915 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.22 
 
 
910 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 
504 aa  223  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 
913 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.32 
 
 
533 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.32 
 
 
493 aa  220  7e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>