176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3454 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  63.03 
 
 
639 aa  823    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.74 
 
 
639 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  87.74 
 
 
636 aa  1163    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
636 aa  1294    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.77 
 
 
627 aa  534  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.18 
 
 
673 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.73 
 
 
673 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.97 
 
 
637 aa  359  8e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.97 
 
 
602 aa  354  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.66 
 
 
639 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.49 
 
 
639 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.28 
 
 
834 aa  309  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.6 
 
 
553 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 
605 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.95 
 
 
772 aa  294  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  40.74 
 
 
795 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.68 
 
 
613 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.78 
 
 
795 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.19 
 
 
618 aa  286  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.81 
 
 
762 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.71 
 
 
609 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  36.44 
 
 
776 aa  277  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.19 
 
 
905 aa  276  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.31 
 
 
618 aa  276  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.78 
 
 
634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.39 
 
 
766 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.36 
 
 
779 aa  275  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 
774 aa  274  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.65 
 
 
790 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.3 
 
 
775 aa  273  8.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.38 
 
 
533 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.84 
 
 
613 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.06 
 
 
526 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  37.71 
 
 
777 aa  267  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  37.36 
 
 
736 aa  267  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.29 
 
 
655 aa  267  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.81 
 
 
542 aa  266  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.24 
 
 
821 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.55 
 
 
549 aa  264  4.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.32 
 
 
505 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.41 
 
 
785 aa  262  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.09 
 
 
781 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 
534 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 
779 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.6 
 
 
529 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.35 
 
 
812 aa  253  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.34 
 
 
527 aa  252  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 
765 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.14 
 
 
812 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.88 
 
 
534 aa  244  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.03 
 
 
760 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.24 
 
 
858 aa  236  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.6 
 
 
546 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  37.09 
 
 
543 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.9 
 
 
665 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.8 
 
 
469 aa  231  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.7 
 
 
547 aa  225  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.82 
 
 
866 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.2 
 
 
863 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.51 
 
 
888 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 
852 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.93 
 
 
853 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.73 
 
 
422 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 
688 aa  217  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.24 
 
 
888 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.2 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.76 
 
 
614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.5 
 
 
545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
888 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.11 
 
 
593 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.95 
 
 
493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.39 
 
 
884 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 
481 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.66 
 
 
549 aa  212  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.88 
 
 
683 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.63 
 
 
584 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.26 
 
 
906 aa  210  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.93 
 
 
504 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
525 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.22 
 
 
797 aa  208  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  31.37 
 
 
889 aa  206  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 
794 aa  206  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.02 
 
 
500 aa  203  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  33.26 
 
 
896 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.15 
 
 
868 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.65 
 
 
811 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.47 
 
 
913 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 
528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.98 
 
 
900 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.03 
 
 
913 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 
915 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.7 
 
 
447 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.82 
 
 
910 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.89 
 
 
688 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.47 
 
 
628 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.22 
 
 
807 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.35 
 
 
525 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.13 
 
 
778 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 
896 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
533 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>