178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3192 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.43 
 
 		 553 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 542 aa  1125    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  54 
 
 		 795 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.87 
 
 		 762 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.09 
 
 		 618 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.31 
 
 		 634 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  48.81 
 
 		 777 aa  512  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.51 
 
 		 790 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.55 
 
 		 613 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.41 
 
 		 609 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.17 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.78 
 
 		 905 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.05 
 
 		 526 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.91 
 
 		 766 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  42.75 
 
 		 795 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.22 
 
 		 775 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.54 
 
 		 613 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.42 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.67 
 
 		 772 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.46 
 
 		 779 aa  435  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.85 
 
 		 774 aa  425  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.55 
 
 		 605 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.21 
 
 		 781 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.91 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.8 
 
 		 785 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  40.92 
 
 		 776 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.88 
 
 		 618 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.07 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.32 
 
 		 534 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  44.22 
 
 		 736 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.72 
 
 		 655 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.82 
 
 		 765 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.39 
 
 		 821 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.76 
 
 		 779 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.59 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.31 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 		 812 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.12 
 
 		 812 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.99 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.82 
 
 		 469 aa  353  5.9999999999999994e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.13 
 
 		 834 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.13 
 
 		 760 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.33 
 
 		 628 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.59 
 
 		 665 aa  346  7e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.25 
 
 		 422 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  37.48 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 		 545 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.02 
 
 		 547 aa  327  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  38.65 
 
 		 614 aa  323  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  36.45 
 
 		 637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  36.96 
 
 		 602 aa  296  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.53 
 
 		 639 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.88 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.53 
 
 		 639 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.72 
 
 		 627 aa  290  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.36 
 
 		 688 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.85 
 
 		 515 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.27 
 
 		 481 aa  281  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  34.18 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.74 
 
 		 688 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.6 
 
 		 683 aa  277  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.03 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.52 
 
 		 593 aa  276  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.99 
 
 		 816 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.88 
 
 		 529 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.9 
 
 		 584 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.07 
 
 		 504 aa  270  5.9999999999999995e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.44 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.1 
 
 		 447 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.81 
 
 		 636 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 		 639 aa  263  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.32 
 
 		 493 aa  259  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 		 636 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 		 639 aa  253  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.4 
 
 		 797 aa  251  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.67 
 
 		 858 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.92 
 
 		 794 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.99 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.76 
 
 		 820 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.33 
 
 		 673 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.25 
 
 		 811 aa  239  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.59 
 
 		 673 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.02 
 
 		 676 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.99 
 
 		 489 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 		 807 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.26 
 
 		 518 aa  226  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.45 
 
 		 866 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.14 
 
 		 778 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  31.51 
 
 		 1140 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.93 
 
 		 863 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.08 
 
 		 852 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.06 
 
 		 500 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.96 
 
 		 530 aa  202  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.68 
 
 		 868 aa  196  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.61 
 
 		 857 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.21 
 
 		 473 aa  183  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.38 
 
 		 919 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 889 aa  172  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05690  N-acetyl-beta-hexosaminidase  26.44 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  25.36 
 
 		 896 aa  171  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>