167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3509 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  50.22 
 
 		 879 aa  884    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  100 
 
 		 896 aa  1868    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  48.41 
 
 		 889 aa  810    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  88.5 
 
 		 896 aa  1645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  87.61 
 
 		 896 aa  1631    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  83.21 
 
 		 935 aa  1606    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.96 
 
 		 884 aa  1145    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.76 
 
 		 910 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.62 
 
 		 888 aa  1130    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  78.37 
 
 		 900 aa  1457    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.99 
 
 		 932 aa  1357    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.37 
 
 		 913 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.74 
 
 		 888 aa  1179    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.75 
 
 		 906 aa  1187    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  72.74 
 
 		 932 aa  1365    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.57 
 
 		 915 aa  717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.23 
 
 		 853 aa  793    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.67 
 
 		 888 aa  1167    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.37 
 
 		 913 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  72.08 
 
 		 935 aa  1358    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  39.62 
 
 		 883 aa  621  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  39.84 
 
 		 883 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  39.38 
 
 		 881 aa  620  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  38.69 
 
 		 883 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.81 
 
 		 919 aa  611  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  39.26 
 
 		 891 aa  608  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.26 
 
 		 891 aa  608  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.18 
 
 		 885 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.25 
 
 		 857 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  36.83 
 
 		 856 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  36.7 
 
 		 833 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  36.83 
 
 		 833 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  36.7 
 
 		 833 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  37.55 
 
 		 836 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.76 
 
 		 837 aa  476  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.57 
 
 		 827 aa  476  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.81 
 
 		 837 aa  475  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.7 
 
 		 833 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.7 
 
 		 833 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.7 
 
 		 833 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.81 
 
 		 828 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.19 
 
 		 827 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.25 
 
 		 827 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.9 
 
 		 858 aa  458  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.9 
 
 		 866 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.11 
 
 		 863 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.54 
 
 		 852 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.08 
 
 		 868 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.08 
 
 		 639 aa  256  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.07 
 
 		 639 aa  253  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  29.34 
 
 		 637 aa  245  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  29.74 
 
 		 602 aa  234  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.55 
 
 		 605 aa  221  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  30.59 
 
 		 639 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.26 
 
 		 636 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.9 
 
 		 639 aa  201  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.56 
 
 		 636 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.62 
 
 		 760 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.91 
 
 		 772 aa  194  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.05 
 
 		 553 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.81 
 
 		 779 aa  188  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 		 774 aa  188  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.03 
 
 		 673 aa  188  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.55 
 
 		 905 aa  188  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.99 
 
 		 673 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.63 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.16 
 
 		 775 aa  185  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.95 
 
 		 766 aa  184  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.93 
 
 		 765 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.36 
 
 		 834 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.66 
 
 		 534 aa  182  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.87 
 
 		 549 aa  182  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.32 
 
 		 613 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.9 
 
 		 762 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.22 
 
 		 469 aa  181  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.19 
 
 		 545 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.75 
 
 		 525 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.07 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 		 655 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.53 
 
 		 527 aa  178  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.75 
 
 		 821 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  29.89 
 
 		 543 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.72 
 
 		 546 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 		 422 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.8 
 
 		 790 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.14 
 
 		 618 aa  174  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.36 
 
 		 542 aa  171  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.56 
 
 		 634 aa  170  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.61 
 
 		 795 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.13 
 
 		 505 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.39 
 
 		 618 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.42 
 
 		 526 aa  168  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.24 
 
 		 665 aa  168  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.78 
 
 		 549 aa  168  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  28.97 
 
 		 736 aa  167  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  26.09 
 
 		 795 aa  167  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.39 
 
 		 613 aa  167  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.9 
 
 		 816 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.02 
 
 		 781 aa  166  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.91 
 
 		 547 aa  165  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>