178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6221 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.23 
 
 		 762 aa  707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 795 aa  1644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  54 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.91 
 
 		 553 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.1 
 
 		 775 aa  547  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.35 
 
 		 618 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.38 
 
 		 613 aa  532  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  37.56 
 
 		 795 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.41 
 
 		 634 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.33 
 
 		 609 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.92 
 
 		 905 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.22 
 
 		 533 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.88 
 
 		 779 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  36.88 
 
 		 776 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.13 
 
 		 790 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.89 
 
 		 772 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.95 
 
 		 766 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.72 
 
 		 774 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  41.18 
 
 		 777 aa  473  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.81 
 
 		 613 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.35 
 
 		 605 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.11 
 
 		 655 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.07 
 
 		 526 aa  435  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  39 
 
 		 618 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.38 
 
 		 781 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.55 
 
 		 765 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.38 
 
 		 760 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  39.39 
 
 		 736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.3 
 
 		 785 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.64 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.15 
 
 		 534 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.9 
 
 		 812 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.74 
 
 		 812 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.65 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.81 
 
 		 779 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.27 
 
 		 834 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37 
 
 		 821 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.1 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.2 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.47 
 
 		 546 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  43.14 
 
 		 469 aa  343  8e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.08 
 
 		 665 aa  340  5e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38 
 
 		 525 aa  337  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 543 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.01 
 
 		 547 aa  327  4.0000000000000003e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.16 
 
 		 628 aa  327  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 		 422 aa  327  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.38 
 
 		 545 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  34.14 
 
 		 639 aa  325  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  38.78 
 
 		 614 aa  320  7e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  34.38 
 
 		 639 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 		 549 aa  302  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.99 
 
 		 637 aa  299  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  33.8 
 
 		 602 aa  297  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34.97 
 
 		 639 aa  296  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.36 
 
 		 447 aa  290  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.78 
 
 		 636 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.66 
 
 		 639 aa  286  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  36.67 
 
 		 558 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 529 aa  283  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 		 636 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 		 627 aa  279  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.04 
 
 		 515 aa  277  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.94 
 
 		 584 aa  274  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.14 
 
 		 481 aa  265  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.01 
 
 		 688 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.58 
 
 		 593 aa  265  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.15 
 
 		 858 aa  265  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.27 
 
 		 688 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.77 
 
 		 533 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 		 528 aa  257  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 		 683 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.89 
 
 		 525 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.26 
 
 		 816 aa  251  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.61 
 
 		 493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 		 489 aa  238  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.35 
 
 		 794 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.1 
 
 		 504 aa  238  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.53 
 
 		 676 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 		 811 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.33 
 
 		 673 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.51 
 
 		 863 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.61 
 
 		 852 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.69 
 
 		 673 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 		 820 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.44 
 
 		 500 aa  222  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  31.4 
 
 		 1140 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 		 518 aa  218  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.89 
 
 		 807 aa  216  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.56 
 
 		 866 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.37 
 
 		 797 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.45 
 
 		 868 aa  214  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.16 
 
 		 778 aa  209  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.67 
 
 		 888 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.96 
 
 		 884 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.19 
 
 		 857 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 		 888 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.91 
 
 		 473 aa  181  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  29.94 
 
 		 883 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>