170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0449 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 447 aa  883    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.32 
 
 		 534 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.8 
 
 		 526 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  51.18 
 
 		 614 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.42 
 
 		 628 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.33 
 
 		 505 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.8 
 
 		 546 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.14 
 
 		 534 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.6 
 
 		 527 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  46.07 
 
 		 543 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.32 
 
 		 545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.14 
 
 		 422 aa  302  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.33 
 
 		 821 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.11 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.49 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.36 
 
 		 795 aa  290  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.7 
 
 		 762 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  40.8 
 
 		 736 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.88 
 
 		 613 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.93 
 
 		 618 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 		 775 aa  273  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.97 
 
 		 774 aa  271  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.76 
 
 		 812 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.55 
 
 		 790 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 		 772 aa  269  8.999999999999999e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.99 
 
 		 812 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.1 
 
 		 542 aa  267  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.52 
 
 		 785 aa  266  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.84 
 
 		 779 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.9 
 
 		 781 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.56 
 
 		 609 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  34.38 
 
 		 795 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.04 
 
 		 525 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 		 905 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.7 
 
 		 634 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  34.49 
 
 		 776 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.81 
 
 		 655 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.06 
 
 		 549 aa  248  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.61 
 
 		 765 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.04 
 
 		 605 aa  246  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.3 
 
 		 766 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  35.68 
 
 		 777 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.02 
 
 		 613 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.21 
 
 		 533 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.52 
 
 		 618 aa  239  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.77 
 
 		 639 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.57 
 
 		 481 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.43 
 
 		 637 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.35 
 
 		 665 aa  237  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.86 
 
 		 760 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.19 
 
 		 639 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.32 
 
 		 515 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.9 
 
 		 593 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.63 
 
 		 602 aa  223  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.09 
 
 		 525 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.67 
 
 		 584 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.52 
 
 		 834 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  36.54 
 
 		 558 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.15 
 
 		 549 aa  213  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.59 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.02 
 
 		 504 aa  209  8e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.66 
 
 		 493 aa  208  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 		 528 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 		 779 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.59 
 
 		 816 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34.9 
 
 		 639 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.58 
 
 		 627 aa  197  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.46 
 
 		 636 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.7 
 
 		 636 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.02 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.63 
 
 		 500 aa  190  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.91 
 
 		 688 aa  189  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.38 
 
 		 533 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.06 
 
 		 639 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.56 
 
 		 673 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 		 489 aa  177  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.48 
 
 		 688 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.25 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.23 
 
 		 683 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.21 
 
 		 858 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.25 
 
 		 673 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.11 
 
 		 797 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.53 
 
 		 794 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 		 820 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.23 
 
 		 866 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.75 
 
 		 852 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.43 
 
 		 863 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.15 
 
 		 1140 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.06 
 
 		 811 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.35 
 
 		 676 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.09 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.62 
 
 		 868 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.53 
 
 		 888 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.23 
 
 		 853 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  38.8 
 
 		 883 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.47 
 
 		 664 aa  131  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.55 
 
 		 651 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.2 
 
 		 722 aa  129  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>