168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5673 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  91.08 
 
 
673 aa  1268    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
673 aa  1369    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.92 
 
 
639 aa  475  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  40.69 
 
 
639 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.73 
 
 
636 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.75 
 
 
627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.37 
 
 
636 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  31.75 
 
 
639 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  31.38 
 
 
639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 
637 aa  310  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  30.51 
 
 
602 aa  293  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 
834 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  36.44 
 
 
736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.49 
 
 
779 aa  253  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  31.39 
 
 
795 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.09 
 
 
775 aa  247  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.12 
 
 
553 aa  247  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.38 
 
 
618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.86 
 
 
762 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.35 
 
 
613 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.73 
 
 
766 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.26 
 
 
655 aa  240  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.17 
 
 
905 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.59 
 
 
542 aa  233  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.1 
 
 
821 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
781 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.62 
 
 
605 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.23 
 
 
609 aa  231  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.69 
 
 
795 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.5 
 
 
790 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.2 
 
 
779 aa  226  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 
774 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.2 
 
 
526 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.39 
 
 
772 aa  221  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 
765 aa  220  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.51 
 
 
613 aa  220  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.52 
 
 
852 aa  220  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  30.87 
 
 
776 aa  220  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.97 
 
 
534 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
785 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.01 
 
 
858 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
533 aa  217  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
634 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.15 
 
 
618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.23 
 
 
812 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
812 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.85 
 
 
505 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.35 
 
 
760 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.16 
 
 
857 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.82 
 
 
863 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.9 
 
 
529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.45 
 
 
527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.15 
 
 
546 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.71 
 
 
549 aa  201  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  29.17 
 
 
777 aa  197  6e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.07 
 
 
543 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.84 
 
 
534 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.9 
 
 
888 aa  194  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.52 
 
 
469 aa  194  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 
896 aa  193  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.43 
 
 
913 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.52 
 
 
866 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.19 
 
 
884 aa  191  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.22 
 
 
547 aa  191  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.57 
 
 
868 aa  190  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.53 
 
 
481 aa  190  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.89 
 
 
888 aa  190  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 
896 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.75 
 
 
593 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  29.03 
 
 
896 aa  188  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.47 
 
 
888 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.26 
 
 
910 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.94 
 
 
853 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.41 
 
 
900 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 
584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.44 
 
 
515 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.9 
 
 
915 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.51 
 
 
913 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.35 
 
 
504 aa  184  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 
558 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.21 
 
 
614 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.71 
 
 
935 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  27.16 
 
 
889 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.68 
 
 
932 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.23 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.32 
 
 
906 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  26.69 
 
 
935 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 
665 aa  174  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.5 
 
 
932 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.18 
 
 
528 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.06 
 
 
533 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.81 
 
 
549 aa  170  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.61 
 
 
628 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.67 
 
 
500 aa  167  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.25 
 
 
447 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.34 
 
 
525 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.08 
 
 
688 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.07 
 
 
1140 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.57 
 
 
525 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.79 
 
 
545 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>