184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1388 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 905 aa  1881    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.32 
 
 		 613 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.57 
 
 		 634 aa  615  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.03 
 
 		 766 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.75 
 
 		 790 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.03 
 
 		 762 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.87 
 
 		 795 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.63 
 
 		 618 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.88 
 
 		 553 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.67 
 
 		 609 aa  509  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.11 
 
 		 613 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  41.74 
 
 		 777 aa  495  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.89 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.73 
 
 		 775 aa  485  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.37 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.33 
 
 		 779 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.23 
 
 		 772 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.46 
 
 		 779 aa  449  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  43.02 
 
 		 776 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.2 
 
 		 774 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  39.3 
 
 		 795 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.93 
 
 		 781 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.46 
 
 		 526 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.38 
 
 		 605 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.03 
 
 		 549 aa  386  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  39.03 
 
 		 736 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.53 
 
 		 785 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.3 
 
 		 834 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.25 
 
 		 655 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.56 
 
 		 765 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.01 
 
 		 821 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.82 
 
 		 618 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.94 
 
 		 760 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.18 
 
 		 812 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.57 
 
 		 534 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.08 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.67 
 
 		 505 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.45 
 
 		 812 aa  364  4e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.19 
 
 		 469 aa  338  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.28 
 
 		 534 aa  337  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.78 
 
 		 546 aa  330  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  35.18 
 
 		 637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.77 
 
 		 628 aa  313  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 		 545 aa  312  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.39 
 
 		 422 aa  312  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  36.9 
 
 		 639 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  34.11 
 
 		 639 aa  309  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  34.53 
 
 		 602 aa  307  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  35.41 
 
 		 614 aa  304  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.55 
 
 		 549 aa  301  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 		 529 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.87 
 
 		 665 aa  291  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.59 
 
 		 543 aa  289  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.5 
 
 		 627 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.47 
 
 		 481 aa  284  6.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 		 525 aa  282  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.7 
 
 		 688 aa  279  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.19 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  36.78 
 
 		 639 aa  276  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.51 
 
 		 547 aa  272  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.67 
 
 		 639 aa  271  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.91 
 
 		 636 aa  271  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.69 
 
 		 558 aa  261  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 		 447 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.15 
 
 		 794 aa  254  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.02 
 
 		 683 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.16 
 
 		 688 aa  252  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.43 
 
 		 673 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.7 
 
 		 533 aa  246  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.81 
 
 		 515 aa  243  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.93 
 
 		 858 aa  243  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.98 
 
 		 584 aa  243  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.11 
 
 		 593 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  35.06 
 
 		 525 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 		 518 aa  241  5.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.17 
 
 		 673 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.6 
 
 		 797 aa  237  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 		 493 aa  235  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.64 
 
 		 504 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.52 
 
 		 852 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.25 
 
 		 528 aa  231  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.91 
 
 		 863 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.55 
 
 		 816 aa  228  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.11 
 
 		 811 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.92 
 
 		 676 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.68 
 
 		 820 aa  221  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.1 
 
 		 866 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.21 
 
 		 807 aa  220  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.72 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.35 
 
 		 868 aa  212  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  29.62 
 
 		 1140 aa  211  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.56 
 
 		 530 aa  211  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.16 
 
 		 853 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.31 
 
 		 884 aa  208  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  27.87 
 
 		 889 aa  202  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.44 
 
 		 778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.31 
 
 		 489 aa  196  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.63 
 
 		 888 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.44 
 
 		 910 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.62 
 
 		 915 aa  190  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>