173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2949 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  41.02 
 
 
879 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  44.37 
 
 
896 aa  708    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  42.57 
 
 
889 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.66 
 
 
896 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.2 
 
 
896 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  41.98 
 
 
935 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.22 
 
 
884 aa  723    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  94.35 
 
 
910 aa  1769    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.89 
 
 
888 aa  754    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.95 
 
 
900 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.19 
 
 
932 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  94.96 
 
 
913 aa  1814    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.51 
 
 
888 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.51 
 
 
906 aa  711    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.16 
 
 
935 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.36 
 
 
932 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  92.9 
 
 
915 aa  1774    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.57 
 
 
853 aa  868    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.37 
 
 
888 aa  748    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
913 aa  1893    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  35.92 
 
 
883 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  35.54 
 
 
881 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  34.52 
 
 
883 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  34.23 
 
 
883 aa  495  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  35.22 
 
 
891 aa  492  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.22 
 
 
891 aa  492  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.47 
 
 
919 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.68 
 
 
885 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.14 
 
 
857 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  32.35 
 
 
856 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  32.22 
 
 
833 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  32.35 
 
 
833 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  32.09 
 
 
833 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  32.82 
 
 
836 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.44 
 
 
837 aa  386  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.56 
 
 
827 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 
837 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 
833 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 
833 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 
833 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.43 
 
 
827 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.87 
 
 
827 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 
828 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 
858 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 
866 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.32 
 
 
852 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.49 
 
 
863 aa  333  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.41 
 
 
868 aa  313  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.12 
 
 
639 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.68 
 
 
602 aa  223  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  32.98 
 
 
637 aa  223  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  31.03 
 
 
639 aa  221  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 
760 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.64 
 
 
605 aa  204  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.03 
 
 
636 aa  198  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.74 
 
 
636 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.33 
 
 
775 aa  195  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.97 
 
 
639 aa  193  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.06 
 
 
766 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.89 
 
 
655 aa  191  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.43 
 
 
905 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 
673 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.32 
 
 
525 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.87 
 
 
765 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  30.63 
 
 
639 aa  188  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
779 aa  185  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.51 
 
 
673 aa  184  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.22 
 
 
785 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 
609 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 
613 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.75 
 
 
627 aa  178  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 
553 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.99 
 
 
774 aa  177  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.54 
 
 
762 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.63 
 
 
772 aa  177  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.26 
 
 
795 aa  177  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  28.87 
 
 
795 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.21 
 
 
546 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.49 
 
 
618 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.39 
 
 
613 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  30.88 
 
 
736 aa  174  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.04 
 
 
533 aa  174  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.12 
 
 
834 aa  173  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.24 
 
 
821 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.29 
 
 
634 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.78 
 
 
618 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.81 
 
 
790 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  29.29 
 
 
776 aa  167  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.15 
 
 
527 aa  167  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.42 
 
 
816 aa  167  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.45 
 
 
549 aa  167  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.67 
 
 
526 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.04 
 
 
820 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.54 
 
 
779 aa  161  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.69 
 
 
528 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.57 
 
 
593 aa  158  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.39 
 
 
469 aa  158  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 
534 aa  157  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.72 
 
 
545 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.03 
 
 
665 aa  156  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>