171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2738 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  87.17 
 
 		 833 aa  1398    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  87.85 
 
 		 856 aa  1402    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  91.05 
 
 		 827 aa  1516    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  86.93 
 
 		 836 aa  1376    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  90.34 
 
 		 837 aa  1508    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  99.03 
 
 		 827 aa  1657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  90.46 
 
 		 837 aa  1510    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  87.29 
 
 		 833 aa  1400    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  87.29 
 
 		 833 aa  1400    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  87.6 
 
 		 833 aa  1398    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  87.72 
 
 		 833 aa  1399    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  87.29 
 
 		 833 aa  1400    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  46.41 
 
 		 883 aa  735    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  46.5 
 
 		 891 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  43.99 
 
 		 883 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.53 
 
 		 919 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.13 
 
 		 885 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  44.47 
 
 		 883 aa  735    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.5 
 
 		 891 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  90.7 
 
 		 828 aa  1495    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 827 aa  1670    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  44.66 
 
 		 881 aa  714    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 		 888 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.2 
 
 		 888 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.5 
 
 		 888 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  36.19 
 
 		 896 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.26 
 
 		 906 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.79 
 
 		 896 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.66 
 
 		 884 aa  459  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  35.16 
 
 		 889 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.68 
 
 		 900 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.74 
 
 		 932 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.45 
 
 		 932 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.2 
 
 		 896 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.97 
 
 		 935 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  33.83 
 
 		 879 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  33.53 
 
 		 935 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 		 857 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 		 853 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.35 
 
 		 913 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 		 910 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.35 
 
 		 913 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.51 
 
 		 915 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.23 
 
 		 866 aa  346  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.92 
 
 		 858 aa  346  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.76 
 
 		 852 aa  320  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.29 
 
 		 863 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.63 
 
 		 868 aa  294  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  30.3 
 
 		 637 aa  213  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  29.07 
 
 		 639 aa  211  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  28.7 
 
 		 639 aa  207  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.37 
 
 		 605 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  30.25 
 
 		 602 aa  191  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 834 aa  190  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 		 760 aa  180  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.05 
 
 		 527 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 		 655 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.85 
 
 		 533 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.36 
 
 		 553 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.71 
 
 		 762 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.37 
 
 		 634 aa  168  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  27.32 
 
 		 469 aa  167  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.72 
 
 		 618 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.44 
 
 		 636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.12 
 
 		 636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.27 
 
 		 779 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.15 
 
 		 765 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.63 
 
 		 772 aa  164  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.32 
 
 		 790 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.82 
 
 		 525 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.96 
 
 		 795 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.26 
 
 		 613 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 		 639 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.66 
 
 		 766 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.19 
 
 		 905 aa  157  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.09 
 
 		 542 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.74 
 
 		 816 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.9 
 
 		 534 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  28.83 
 
 		 736 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.6 
 
 		 493 aa  154  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.43 
 
 		 821 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 		 422 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.36 
 
 		 584 aa  152  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.46 
 
 		 639 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.43 
 
 		 627 aa  150  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.69 
 
 		 481 aa  150  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  26.96 
 
 		 795 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.03 
 
 		 781 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.65 
 
 		 526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.88 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.32 
 
 		 609 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.76 
 
 		 785 aa  149  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.36 
 
 		 775 aa  147  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.59 
 
 		 618 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.38 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.97 
 
 		 779 aa  145  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.2 
 
 		 613 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.42 
 
 		 529 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.19 
 
 		 593 aa  144  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.69 
 
 		 504 aa  144  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>