171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2880 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  87.15 
 
 		 833 aa  1396    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  87.84 
 
 		 856 aa  1399    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  91.17 
 
 		 827 aa  1513    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  87.04 
 
 		 836 aa  1376    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  90.46 
 
 		 837 aa  1506    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 827 aa  1669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  90.58 
 
 		 837 aa  1508    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  87.28 
 
 		 833 aa  1397    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  87.28 
 
 		 833 aa  1397    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  87.58 
 
 		 833 aa  1396    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  87.71 
 
 		 833 aa  1397    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  87.28 
 
 		 833 aa  1397    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  46.53 
 
 		 883 aa  737    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  46.87 
 
 		 891 aa  762    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  44.23 
 
 		 883 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.62 
 
 		 885 aa  756    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.87 
 
 		 891 aa  762    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  90.82 
 
 		 828 aa  1491    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  99.03 
 
 		 827 aa  1657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.11 
 
 		 919 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  44.66 
 
 		 881 aa  715    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  44.71 
 
 		 883 aa  737    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 		 888 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.45 
 
 		 888 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.5 
 
 		 888 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  36.57 
 
 		 896 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.52 
 
 		 906 aa  465  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  35.45 
 
 		 889 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.79 
 
 		 896 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.79 
 
 		 884 aa  459  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.27 
 
 		 900 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.2 
 
 		 932 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.94 
 
 		 932 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.2 
 
 		 896 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.31 
 
 		 935 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  33.66 
 
 		 879 aa  439  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 		 935 aa  438  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 		 857 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 		 853 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.9 
 
 		 913 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 		 910 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 		 915 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 		 913 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.49 
 
 		 858 aa  345  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.35 
 
 		 866 aa  344  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.63 
 
 		 852 aa  317  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 863 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.63 
 
 		 868 aa  293  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  30.3 
 
 		 637 aa  213  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  29.26 
 
 		 639 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  28.89 
 
 		 639 aa  208  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.19 
 
 		 605 aa  197  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  30.46 
 
 		 602 aa  193  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 834 aa  191  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.84 
 
 		 760 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.9 
 
 		 655 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.05 
 
 		 527 aa  174  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.66 
 
 		 533 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.36 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.71 
 
 		 762 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.37 
 
 		 634 aa  168  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  26.95 
 
 		 469 aa  168  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.45 
 
 		 618 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.33 
 
 		 636 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.01 
 
 		 779 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.15 
 
 		 765 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 		 795 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.23 
 
 		 636 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.82 
 
 		 525 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.11 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.07 
 
 		 766 aa  161  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.61 
 
 		 772 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.68 
 
 		 613 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.89 
 
 		 905 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.74 
 
 		 816 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.1 
 
 		 534 aa  156  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.88 
 
 		 542 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  28.27 
 
 		 639 aa  155  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.74 
 
 		 639 aa  154  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.6 
 
 		 493 aa  153  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.43 
 
 		 821 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.54 
 
 		 584 aa  152  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.14 
 
 		 422 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  28.63 
 
 		 736 aa  151  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.57 
 
 		 627 aa  151  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.07 
 
 		 781 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  26.76 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.88 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.55 
 
 		 609 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.51 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.46 
 
 		 526 aa  148  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.59 
 
 		 618 aa  148  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.76 
 
 		 785 aa  147  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.36 
 
 		 775 aa  147  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.11 
 
 		 549 aa  145  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  29.01 
 
 		 558 aa  145  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.97 
 
 		 779 aa  145  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.85 
 
 		 665 aa  145  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.42 
 
 		 529 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.69 
 
 		 504 aa  144  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>