166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1232 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  46.38 
 
 		 833 aa  746    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  46.51 
 
 		 856 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.17 
 
 		 827 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  46.98 
 
 		 836 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.71 
 
 		 837 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.14 
 
 		 827 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.58 
 
 		 837 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  46.38 
 
 		 833 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  46.38 
 
 		 833 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  46.38 
 
 		 833 aa  748    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  46.51 
 
 		 833 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  46.38 
 
 		 833 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.85 
 
 		 919 aa  830    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  55.58 
 
 		 883 aa  1013    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  75.14 
 
 		 891 aa  1419    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  53.51 
 
 		 883 aa  993    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 885 aa  1839    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  75.14 
 
 		 891 aa  1419    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.46 
 
 		 828 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.63 
 
 		 827 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  53.79 
 
 		 883 aa  990    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  52.98 
 
 		 881 aa  972    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.04 
 
 		 888 aa  621  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.53 
 
 		 888 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  38.18 
 
 		 896 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.76 
 
 		 896 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.86 
 
 		 896 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.16 
 
 		 888 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.61 
 
 		 884 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.53 
 
 		 906 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 		 935 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  37.83 
 
 		 879 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.67 
 
 		 900 aa  555  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  36.93 
 
 		 889 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 		 932 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.57 
 
 		 935 aa  539  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.41 
 
 		 932 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.08 
 
 		 853 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.04 
 
 		 857 aa  499  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.56 
 
 		 910 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.68 
 
 		 913 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.88 
 
 		 913 aa  476  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.56 
 
 		 915 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.82 
 
 		 858 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.4 
 
 		 866 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 		 852 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.96 
 
 		 863 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 		 868 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  28.17 
 
 		 639 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  27.39 
 
 		 639 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  26.94 
 
 		 637 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  27.32 
 
 		 602 aa  213  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 		 605 aa  212  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.29 
 
 		 905 aa  195  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.95 
 
 		 779 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.46 
 
 		 527 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.76 
 
 		 655 aa  183  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.53 
 
 		 553 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.03 
 
 		 613 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.62 
 
 		 760 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.61 
 
 		 618 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.37 
 
 		 526 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.34 
 
 		 766 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  25.48 
 
 		 777 aa  171  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.68 
 
 		 834 aa  171  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  28.43 
 
 		 736 aa  171  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.78 
 
 		 634 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.37 
 
 		 774 aa  169  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.12 
 
 		 795 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.96 
 
 		 790 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.84 
 
 		 609 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.51 
 
 		 613 aa  168  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.8 
 
 		 781 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.01 
 
 		 812 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.29 
 
 		 775 aa  167  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.68 
 
 		 772 aa  167  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  28.63 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.62 
 
 		 584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.72 
 
 		 636 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.23 
 
 		 812 aa  164  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.82 
 
 		 593 aa  164  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.67 
 
 		 785 aa  163  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.31 
 
 		 627 aa  162  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.26 
 
 		 533 aa  162  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.71 
 
 		 762 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  27.07 
 
 		 639 aa  161  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.56 
 
 		 639 aa  160  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.48 
 
 		 765 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.54 
 
 		 542 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.72 
 
 		 618 aa  158  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.81 
 
 		 636 aa  157  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.4 
 
 		 525 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.24 
 
 		 528 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.88 
 
 		 673 aa  154  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.22 
 
 		 779 aa  153  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  26.31 
 
 		 795 aa  151  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.36 
 
 		 505 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  23.89 
 
 		 776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.79 
 
 		 673 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.82 
 
 		 821 aa  149  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>