174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3656 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
655 aa  1363    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.9 
 
 
618 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.57 
 
 
605 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.11 
 
 
795 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.72 
 
 
613 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.63 
 
 
553 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.64 
 
 
779 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.4 
 
 
772 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.92 
 
 
762 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.34 
 
 
618 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.8 
 
 
634 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.59 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.84 
 
 
790 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.72 
 
 
542 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.25 
 
 
774 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  36.89 
 
 
795 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.25 
 
 
905 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.11 
 
 
533 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  36.23 
 
 
777 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  37.32 
 
 
776 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.68 
 
 
609 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.51 
 
 
812 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.21 
 
 
812 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  39.02 
 
 
736 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.75 
 
 
781 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.67 
 
 
834 aa  359  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.43 
 
 
766 aa  357  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.12 
 
 
821 aa  356  8.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.19 
 
 
613 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.93 
 
 
775 aa  347  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.11 
 
 
765 aa  347  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.75 
 
 
527 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
760 aa  337  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.19 
 
 
505 aa  336  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.38 
 
 
534 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.17 
 
 
785 aa  326  9e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.62 
 
 
779 aa  317  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 
546 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  35.07 
 
 
637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  37.82 
 
 
639 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  35.84 
 
 
602 aa  303  9e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.15 
 
 
549 aa  300  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  36.73 
 
 
639 aa  299  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.68 
 
 
665 aa  298  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.03 
 
 
481 aa  297  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.15 
 
 
534 aa  296  9e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.18 
 
 
469 aa  295  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.24 
 
 
515 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.75 
 
 
547 aa  283  9e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.84 
 
 
614 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 
525 aa  280  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.11 
 
 
593 aa  280  7e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  34.89 
 
 
558 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  36.44 
 
 
543 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.22 
 
 
628 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.82 
 
 
525 aa  274  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.17 
 
 
545 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.25 
 
 
549 aa  273  7e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.97 
 
 
529 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 
422 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.24 
 
 
528 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.58 
 
 
688 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.29 
 
 
636 aa  267  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.78 
 
 
584 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34.39 
 
 
639 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 
627 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.69 
 
 
636 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 
688 aa  259  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  35.1 
 
 
816 aa  257  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.93 
 
 
683 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.81 
 
 
447 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.66 
 
 
493 aa  248  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.16 
 
 
673 aa  247  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.4 
 
 
518 aa  243  9e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.98 
 
 
533 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.89 
 
 
820 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.39 
 
 
639 aa  240  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.26 
 
 
673 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.52 
 
 
504 aa  239  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.42 
 
 
858 aa  237  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  32.56 
 
 
1140 aa  237  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.91 
 
 
794 aa  233  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.18 
 
 
797 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.74 
 
 
866 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 
807 aa  224  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.64 
 
 
676 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.19 
 
 
852 aa  211  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.2 
 
 
811 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.67 
 
 
863 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.68 
 
 
500 aa  206  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.42 
 
 
868 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.08 
 
 
857 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  30.92 
 
 
881 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.28 
 
 
884 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.66 
 
 
778 aa  194  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.69 
 
 
910 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.89 
 
 
913 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.89 
 
 
913 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.04 
 
 
915 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  29.77 
 
 
883 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>