167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2936 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  49.22 
 
 		 879 aa  873    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  88.5 
 
 		 896 aa  1672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  48.01 
 
 		 889 aa  810    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 896 aa  1864    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  97.88 
 
 		 896 aa  1802    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  91.66 
 
 		 935 aa  1752    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  63.63 
 
 		 884 aa  1157    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.08 
 
 		 910 aa  723    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.74 
 
 		 888 aa  1141    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  80.11 
 
 		 900 aa  1484    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  72.74 
 
 		 932 aa  1361    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.01 
 
 		 913 aa  720    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  63.44 
 
 		 888 aa  1191    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  63.43 
 
 		 906 aa  1211    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  73.14 
 
 		 932 aa  1371    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.84 
 
 		 915 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.82 
 
 		 853 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  64.18 
 
 		 888 aa  1193    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.77 
 
 		 913 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  73.12 
 
 		 935 aa  1367    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  39.81 
 
 		 881 aa  625  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  39.58 
 
 		 891 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  39.18 
 
 		 883 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.58 
 
 		 891 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  40.29 
 
 		 883 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.1 
 
 		 919 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.76 
 
 		 885 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  38.73 
 
 		 883 aa  602  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 		 857 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.5 
 
 		 837 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  36.58 
 
 		 856 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.79 
 
 		 827 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 		 837 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  36.45 
 
 		 833 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  36.58 
 
 		 833 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 		 828 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  36.45 
 
 		 833 aa  466  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.06 
 
 		 858 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.45 
 
 		 833 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.45 
 
 		 833 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.45 
 
 		 833 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.79 
 
 		 827 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  36.73 
 
 		 836 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.73 
 
 		 827 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 		 866 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 		 863 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.78 
 
 		 852 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 		 868 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  30.32 
 
 		 639 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  30.28 
 
 		 639 aa  248  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  28.61 
 
 		 637 aa  233  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  30.5 
 
 		 602 aa  227  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.43 
 
 		 605 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  31.79 
 
 		 639 aa  205  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.75 
 
 		 760 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  31 
 
 		 639 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 		 673 aa  199  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.05 
 
 		 636 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.28 
 
 		 673 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.14 
 
 		 636 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.26 
 
 		 766 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.36 
 
 		 553 aa  195  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.82 
 
 		 905 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.27 
 
 		 655 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.11 
 
 		 775 aa  189  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.27 
 
 		 534 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.42 
 
 		 762 aa  189  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.77 
 
 		 772 aa  187  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.81 
 
 		 779 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.01 
 
 		 774 aa  181  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.87 
 
 		 546 aa  181  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 		 613 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.89 
 
 		 549 aa  178  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.42 
 
 		 609 aa  178  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.81 
 
 		 765 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.14 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.11 
 
 		 525 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.58 
 
 		 627 aa  174  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.04 
 
 		 527 aa  174  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  30.53 
 
 		 543 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  26.5 
 
 		 795 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.89 
 
 		 542 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.96 
 
 		 834 aa  174  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 		 795 aa  173  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.06 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.27 
 
 		 526 aa  171  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.41 
 
 		 618 aa  171  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.75 
 
 		 821 aa  171  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.86 
 
 		 469 aa  171  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.7 
 
 		 618 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.28 
 
 		 422 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.56 
 
 		 534 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.43 
 
 		 779 aa  168  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  30.28 
 
 		 736 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.27 
 
 		 533 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.8 
 
 		 665 aa  165  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 		 505 aa  165  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.9 
 
 		 634 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.89 
 
 		 549 aa  164  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.12 
 
 		 613 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>