177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1005 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
688 aa  1385    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.31 
 
 
683 aa  600  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.93 
 
 
688 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.42 
 
 
676 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.17 
 
 
797 aa  399  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.89 
 
 
794 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  39.82 
 
 
1140 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.32 
 
 
811 aa  364  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  40.14 
 
 
807 aa  359  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.18 
 
 
778 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.36 
 
 
542 aa  296  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.56 
 
 
618 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.81 
 
 
613 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.91 
 
 
790 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.49 
 
 
553 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  33.27 
 
 
777 aa  282  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.58 
 
 
655 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.99 
 
 
781 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.2 
 
 
785 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.38 
 
 
795 aa  273  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.25 
 
 
533 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.96 
 
 
774 aa  271  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.57 
 
 
605 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  37.83 
 
 
736 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 
772 aa  270  8.999999999999999e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
762 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.02 
 
 
609 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.51 
 
 
534 aa  263  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.83 
 
 
526 aa  263  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.56 
 
 
905 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.13 
 
 
665 aa  260  5.0000000000000005e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.14 
 
 
775 aa  260  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.75 
 
 
634 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.44 
 
 
505 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  30.74 
 
 
776 aa  252  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.85 
 
 
821 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 
765 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.38 
 
 
779 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.83 
 
 
618 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
812 aa  248  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.48 
 
 
812 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.38 
 
 
760 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  31.81 
 
 
795 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.32 
 
 
613 aa  243  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.28 
 
 
766 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.88 
 
 
549 aa  240  6.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.29 
 
 
527 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.86 
 
 
545 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.73 
 
 
547 aa  227  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.74 
 
 
779 aa  227  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  35.44 
 
 
543 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.01 
 
 
546 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.15 
 
 
834 aa  224  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.5 
 
 
469 aa  223  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.87 
 
 
534 aa  223  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  31.2 
 
 
602 aa  219  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  32.72 
 
 
639 aa  216  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.61 
 
 
614 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 
515 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 
529 aa  212  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  30.88 
 
 
637 aa  208  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.81 
 
 
525 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 
481 aa  206  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  29.21 
 
 
639 aa  206  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.09 
 
 
584 aa  203  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.89 
 
 
636 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.92 
 
 
558 aa  201  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.8 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.4 
 
 
500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.66 
 
 
525 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 
593 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 
627 aa  190  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  29.54 
 
 
639 aa  188  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.97 
 
 
549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.08 
 
 
504 aa  184  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
493 aa  184  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  27.08 
 
 
603 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.31 
 
 
636 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.57 
 
 
816 aa  179  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.48 
 
 
447 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.96 
 
 
628 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.34 
 
 
614 aa  178  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 
639 aa  177  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.97 
 
 
820 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49563  predicted protein  31.61 
 
 
973 aa  168  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.73 
 
 
518 aa  168  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.8 
 
 
489 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.74 
 
 
528 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.93 
 
 
530 aa  160  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.73 
 
 
673 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  36.5 
 
 
503 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 
673 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.07 
 
 
858 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.68 
 
 
533 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.4 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.74 
 
 
866 aa  134  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  27.25 
 
 
889 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.04 
 
 
479 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05690  N-acetyl-beta-hexosaminidase  27.13 
 
 
476 aa  131  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.24 
 
 
852 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>