162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0232 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
479 aa  966    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  48.43 
 
 
473 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.61 
 
 
500 aa  313  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.43 
 
 
489 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.77 
 
 
584 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 
593 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.93 
 
 
530 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  40.72 
 
 
558 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.34 
 
 
515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 
528 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.12 
 
 
816 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.06 
 
 
533 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.49 
 
 
525 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.53 
 
 
820 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.58 
 
 
422 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.81 
 
 
609 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  30.18 
 
 
795 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.06 
 
 
534 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  27.5 
 
 
639 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.45 
 
 
527 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 
775 aa  176  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.88 
 
 
779 aa  173  5.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.38 
 
 
795 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.54 
 
 
779 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.98 
 
 
636 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.77 
 
 
905 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  35.02 
 
 
543 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.31 
 
 
542 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.65 
 
 
529 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.98 
 
 
613 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 
821 aa  166  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.9 
 
 
766 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  27.25 
 
 
639 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  29.81 
 
 
637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.58 
 
 
553 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.45 
 
 
481 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.21 
 
 
655 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.83 
 
 
636 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.68 
 
 
613 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.88 
 
 
790 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 
546 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.05 
 
 
665 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.32 
 
 
618 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  26.49 
 
 
777 aa  160  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.54 
 
 
469 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.08 
 
 
785 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.98 
 
 
774 aa  157  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
526 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.55 
 
 
534 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.73 
 
 
533 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.12 
 
 
505 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.01 
 
 
545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.11 
 
 
605 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.35 
 
 
772 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.33 
 
 
812 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.33 
 
 
812 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.27 
 
 
834 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.31 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  30.08 
 
 
639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.24 
 
 
866 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.57 
 
 
762 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.56 
 
 
627 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.85 
 
 
760 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  26.85 
 
 
602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  28.95 
 
 
776 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.94 
 
 
634 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.46 
 
 
765 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.71 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.09 
 
 
447 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.39 
 
 
618 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.08 
 
 
493 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.48 
 
 
614 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.14 
 
 
781 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.34 
 
 
673 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.27 
 
 
811 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.15 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.43 
 
 
852 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.67 
 
 
549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.13 
 
 
673 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.33 
 
 
639 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.17 
 
 
797 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.33 
 
 
628 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.87 
 
 
863 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.68 
 
 
683 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.8 
 
 
525 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  29.78 
 
 
736 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.27 
 
 
518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.94 
 
 
858 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  29.66 
 
 
1140 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.16 
 
 
857 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.78 
 
 
688 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.8 
 
 
794 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.66 
 
 
884 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.64 
 
 
868 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.93 
 
 
853 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  24.96 
 
 
896 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.63 
 
 
910 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.73 
 
 
688 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.6 
 
 
915 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.01 
 
 
913 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>