160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05690  N-acetyl-beta-hexosaminidase  100 
 
 
476 aa  944    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.38 
 
 
553 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.5 
 
 
613 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.84 
 
 
785 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.1 
 
 
781 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.7 
 
 
762 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.16 
 
 
775 aa  192  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.44 
 
 
821 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.54 
 
 
790 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  31.11 
 
 
736 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.15 
 
 
779 aa  184  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.13 
 
 
609 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.83 
 
 
618 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  29.54 
 
 
777 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  29 
 
 
549 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.4 
 
 
542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.82 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.72 
 
 
812 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 
812 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.68 
 
 
618 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.41 
 
 
779 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.69 
 
 
905 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 
546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.3 
 
 
766 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.47 
 
 
665 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  30.34 
 
 
639 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  24.61 
 
 
776 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.38 
 
 
534 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.11 
 
 
613 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.9 
 
 
627 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.34 
 
 
760 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.35 
 
 
636 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  43.26 
 
 
469 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  28.29 
 
 
639 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  29.37 
 
 
543 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.66 
 
 
547 aa  155  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.27 
 
 
673 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.8 
 
 
533 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.86 
 
 
795 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  28.04 
 
 
637 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.83 
 
 
518 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.13 
 
 
673 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  27.17 
 
 
639 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.52 
 
 
636 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.82 
 
 
525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  28.1 
 
 
602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.82 
 
 
639 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.08 
 
 
834 aa  146  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  36.76 
 
 
795 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.27 
 
 
774 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.72 
 
 
481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.68 
 
 
765 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.91 
 
 
634 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.59 
 
 
527 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.19 
 
 
655 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.89 
 
 
422 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.39 
 
 
549 aa  133  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.24 
 
 
605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.73 
 
 
772 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.89 
 
 
593 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.52 
 
 
614 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.98 
 
 
534 aa  124  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.13 
 
 
688 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.7 
 
 
505 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.94 
 
 
504 aa  123  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.42 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.78 
 
 
584 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.06 
 
 
676 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.61 
 
 
857 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.5 
 
 
529 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.86 
 
 
858 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.11 
 
 
853 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.71 
 
 
493 aa  116  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.11 
 
 
896 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  25.78 
 
 
883 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  25.73 
 
 
883 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 
794 aa  113  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.89 
 
 
896 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.83 
 
 
688 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.44 
 
 
906 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.55 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  25.55 
 
 
896 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
883 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.77 
 
 
913 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.52 
 
 
683 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  25.05 
 
 
1140 aa  110  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
820 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.78 
 
 
888 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.99 
 
 
913 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.55 
 
 
915 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.05 
 
 
852 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.65 
 
 
628 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.36 
 
 
888 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.12 
 
 
797 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.84 
 
 
900 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.82 
 
 
811 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.87 
 
 
863 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 
884 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.18 
 
 
533 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.55 
 
 
778 aa  103  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>