169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0948 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 441 aa  872    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  80.82 
 
 		 437 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  66.04 
 
 		 443 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  60.51 
 
 		 426 aa  519  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.5 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  59.08 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  58.85 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  59.31 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  54.22 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  51.45 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  51.61 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  52.91 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  51.49 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  53.1 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  53.1 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  53.33 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  51.26 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  51.26 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  51.26 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  51.49 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  51.48 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  52.06 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  54.46 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  44.39 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  45.79 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  44.87 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  45.77 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  44.24 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  46.03 
 
 		 408 aa  342  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  42.23 
 
 		 438 aa  339  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  46.99 
 
 		 429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  41.61 
 
 		 431 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  44.26 
 
 		 406 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  43.08 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  44.12 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  42.24 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  43.33 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  40.83 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  40.37 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  35.95 
 
 		 1140 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  31.81 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  33.73 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  32.95 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  32.23 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  33.73 
 
 		 431 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.94 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  35.6 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  35.93 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  35.6 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  35.6 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  36.07 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  35.6 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  33.03 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  35.93 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  30.36 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  32.11 
 
 		 407 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  31.8 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  31.19 
 
 		 431 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  31.82 
 
 		 417 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.87 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  31.12 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.05 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  35.13 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  34.34 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  31.59 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  31.98 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  33.81 
 
 		 435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  32.55 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  31.64 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  32.27 
 
 		 458 aa  180  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  32.7 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  34.52 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.26 
 
 		 427 aa  179  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.89 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  32.56 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.71 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  30.93 
 
 		 436 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.39 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  32.46 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  29.75 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.21 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  29.57 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  31.07 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  28.41 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  31.26 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  28.74 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  28.81 
 
 		 443 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  28.81 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  32.76 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  33.66 
 
 		 413 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  28.04 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  27.36 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  27.36 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  27.06 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.7 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>