168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6560 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 438 aa  873    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  58.04 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  47.64 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  49.3 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  49.64 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  49.52 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  49.05 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  42.89 
 
 		 440 aa  361  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  45.45 
 
 		 406 aa  359  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.16 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  41.74 
 
 		 444 aa  348  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  44.84 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  42.89 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  42.56 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  44.62 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.23 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  41.31 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  44 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  44.71 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  42.79 
 
 		 413 aa  315  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  38.94 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.55 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  39.67 
 
 		 1140 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 452 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  38.58 
 
 		 432 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  38.58 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  38.58 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  38.58 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  40 
 
 		 452 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  38.8 
 
 		 435 aa  289  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  37.89 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  39.15 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  38.24 
 
 		 433 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  37.92 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  37.92 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  37.81 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  40.04 
 
 		 432 aa  286  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  39.02 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  38.75 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  34.25 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  34.02 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  32.94 
 
 		 436 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  32.95 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  35 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  33.64 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  32.64 
 
 		 407 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  31.8 
 
 		 424 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.37 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.65 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.65 
 
 		 421 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.69 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  32.49 
 
 		 415 aa  193  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.99 
 
 		 428 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  32.03 
 
 		 415 aa  189  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  33.67 
 
 		 428 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  31.81 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.32 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  32.24 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  32.19 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  31.58 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.32 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  31.62 
 
 		 417 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.42 
 
 		 415 aa  186  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  31.35 
 
 		 423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.06 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  32.3 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  29.65 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.72 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  29.49 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  30.54 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  31.31 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  31.4 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.17 
 
 		 437 aa  176  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  31.85 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  31.26 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  31.98 
 
 		 428 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  31.84 
 
 		 436 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  27.81 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  29.82 
 
 		 440 aa  166  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  30.64 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  29.39 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  31.02 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  31.02 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  29.91 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  28.61 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  30.78 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  29.78 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.53 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  31.67 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  28.53 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  28.53 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  28.53 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  28.53 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  30.53 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>