168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6211 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  71.46 
 
 		 444 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 431 aa  861    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  69.63 
 
 		 440 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  70.99 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  45.8 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.81 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  45.65 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  42.56 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  43.34 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  40.22 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  42.76 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.61 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  42.2 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.55 
 
 		 438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  44.68 
 
 		 408 aa  329  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 452 aa  319  6e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  43.66 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  44.08 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  44.39 
 
 		 430 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  39.13 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  40 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  35.97 
 
 		 435 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  35.55 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  37.92 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  39.15 
 
 		 429 aa  278  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  35.99 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  35.76 
 
 		 432 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  35.76 
 
 		 432 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  35.76 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  35.76 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  36.71 
 
 		 435 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  36.04 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  36.04 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  36.67 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  35.75 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  34.68 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  37.15 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  35.1 
 
 		 1140 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  33.89 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  33.65 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  31.69 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  29.63 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.55 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  33.03 
 
 		 436 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.59 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  32.21 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  32.21 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  32.21 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  32.21 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  31.97 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  31.64 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  31.03 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  32.68 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  30.18 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  30.23 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  30.75 
 
 		 435 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  31.31 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  31.63 
 
 		 415 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  30.99 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  31.25 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  30.93 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  30.51 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  30.19 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  31.14 
 
 		 421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  30.83 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  30.94 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  31.21 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  30.46 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  30.83 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.23 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  30.83 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  30.22 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  31.82 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  30.54 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  28.97 
 
 		 431 aa  176  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  29.79 
 
 		 410 aa  176  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  29.71 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  30.18 
 
 		 440 aa  172  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  28.87 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  29.15 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  28.38 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  29.31 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  29.79 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  29.1 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  29.08 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  30.09 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  29.08 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  29.08 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  29.08 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  29.08 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  29.88 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  29.08 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  28.44 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  28.44 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  28.44 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  28.44 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  28.44 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  27.18 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>