169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0466 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  100 
 
 
408 aa  804    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  64.78 
 
 
406 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  62.59 
 
 
413 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  50.61 
 
 
419 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  45.63 
 
 
444 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  46.06 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.1 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  46.59 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  46.9 
 
 
429 aa  355  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.26 
 
 
441 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  43.29 
 
 
440 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  44.47 
 
 
438 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  43.86 
 
 
441 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  45.48 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  46.52 
 
 
407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  45.57 
 
 
429 aa  331  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  46.21 
 
 
429 aa  325  8.000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.6 
 
 
438 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  42.89 
 
 
446 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  42.65 
 
 
429 aa  323  5e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  44.27 
 
 
452 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  44.04 
 
 
452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  42.16 
 
 
429 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  43.35 
 
 
452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  42.14 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  42.14 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  42.14 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  42.14 
 
 
432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  41.15 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  46 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  41.65 
 
 
432 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  40.46 
 
 
433 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  41.24 
 
 
435 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  42.11 
 
 
433 aa  298  8e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  41.24 
 
 
432 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  41.24 
 
 
432 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  41.24 
 
 
432 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  40.46 
 
 
434 aa  288  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  39.66 
 
 
1140 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  39.2 
 
 
418 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  33.65 
 
 
424 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  35.86 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  35.61 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  35.61 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  35.61 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  35.61 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  35.61 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 
435 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  34.21 
 
 
436 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  34.27 
 
 
415 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  33.74 
 
 
412 aa  206  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.76 
 
 
415 aa  205  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  34.07 
 
 
424 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  33.97 
 
 
417 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  33.83 
 
 
428 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  34.52 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  32.76 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  34.92 
 
 
423 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  35.1 
 
 
410 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  34.04 
 
 
428 aa  199  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  35.43 
 
 
423 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  35.18 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  34.43 
 
 
431 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  34.71 
 
 
421 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.29 
 
 
417 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  34.35 
 
 
420 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.17 
 
 
423 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 
421 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  33.41 
 
 
431 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.92 
 
 
431 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.92 
 
 
431 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.67 
 
 
431 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  31.6 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.23 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  32.58 
 
 
428 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  33.5 
 
 
403 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  30.97 
 
 
432 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  30.96 
 
 
435 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  32.35 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  33 
 
 
426 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  31.49 
 
 
427 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  31.91 
 
 
468 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.61 
 
 
436 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  33.91 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  31.73 
 
 
412 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.3 
 
 
437 aa  170  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  30.87 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  30.21 
 
 
440 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  32.22 
 
 
457 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.23 
 
 
471 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  32.22 
 
 
457 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  32.22 
 
 
457 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  31.41 
 
 
457 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  27.54 
 
 
438 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  30.77 
 
 
411 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  27.54 
 
 
438 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  27.54 
 
 
438 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  27.54 
 
 
438 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  27.82 
 
 
438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>