166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3687 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 413 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  74.21 
 
 		 406 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  61.52 
 
 		 408 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  49.03 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  44.04 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  45.96 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  42.79 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  43.54 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.66 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  42.79 
 
 		 438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  42.73 
 
 		 437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  42.07 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 452 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.12 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.08 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  42.99 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 452 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  42.19 
 
 		 446 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  44.31 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  44.31 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  44.8 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  44.55 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  43.58 
 
 		 429 aa  298  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  43.7 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  38.36 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  38.69 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  39.91 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  38.86 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  38.86 
 
 		 432 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  38.86 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  38.86 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  40 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  38.41 
 
 		 432 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  38.86 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  38.86 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  39.09 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  39.95 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  38.46 
 
 		 1140 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  38.82 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  34.37 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  32.24 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.59 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.47 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  33.25 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  32.7 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  33.41 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  35.19 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.4 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.76 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.76 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.76 
 
 		 431 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  31.73 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  32.93 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  32.93 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  32.93 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  32.93 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  32.93 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  32.3 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.51 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 415 aa  189  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.63 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.81 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  33.82 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  31.05 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  33.82 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  32.67 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.62 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  33.33 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.63 
 
 		 423 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  32.04 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  31.04 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.09 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.11 
 
 		 458 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.73 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  32.63 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  30.55 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  30.58 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  30.49 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  28.54 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.15 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  32.91 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  28.64 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  29.13 
 
 		 417 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  27.47 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  27.47 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  27.47 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  27.47 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  32.09 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  27.47 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  29.84 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  28.99 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  29.3 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  29.3 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>