168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3038 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 443 aa  879    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  66.21 
 
 		 437 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  64.64 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  59.53 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  59.09 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  59.32 
 
 		 452 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.58 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  58.86 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  52.86 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  51.5 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  50 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  50.23 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  50 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  50.23 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  49.54 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  50.81 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  50.34 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  50.23 
 
 		 432 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  50.23 
 
 		 432 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  51.73 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  49.2 
 
 		 433 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  50.23 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  51.76 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  46.99 
 
 		 444 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  44.3 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  45.01 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  43.67 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  45.35 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  44.08 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  45.71 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  45.33 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  46.85 
 
 		 408 aa  346  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  46.52 
 
 		 429 aa  339  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  42.38 
 
 		 413 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  45.69 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  43.2 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  43.22 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  44.09 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  43.22 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  36.58 
 
 		 1140 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  31.39 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  32.78 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  33.11 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  32.1 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  32.15 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  31.44 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  31.65 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  31.61 
 
 		 431 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  32.7 
 
 		 407 aa  193  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  33.49 
 
 		 417 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  31.46 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  31.17 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.71 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.94 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.79 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  31.52 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  34.05 
 
 		 415 aa  186  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  31.78 
 
 		 435 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.81 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  33.1 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  32.87 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.47 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  32.64 
 
 		 426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  31.76 
 
 		 410 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  32.89 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  30.85 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.02 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  33.48 
 
 		 436 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  32.89 
 
 		 423 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  30.34 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  31.07 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  30.7 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  32.94 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  29.98 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  31.75 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  30.31 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  31.59 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  30.73 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  28.57 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.42 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  30.73 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  29.36 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  30.56 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  29.36 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  29.36 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  29.36 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  29.36 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  31.47 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  30.56 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  27.8 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  29.13 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  30.59 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>