174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3207 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  77.65 
 
 		 433 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  93.06 
 
 		 435 aa  789    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  83.8 
 
 		 433 aa  728    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  92.13 
 
 		 432 aa  779    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  92.13 
 
 		 432 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  92.13 
 
 		 432 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  99.77 
 
 		 432 aa  855    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  86.6 
 
 		 418 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  96.99 
 
 		 432 aa  836    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  85.42 
 
 		 435 aa  750    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  99.77 
 
 		 432 aa  855    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  85.42 
 
 		 434 aa  729    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  99.31 
 
 		 432 aa  849    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 432 aa  856    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  52.62 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.26 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  50.58 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.31 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  48.32 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  49.18 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  50 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  50.79 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  37.7 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  39.86 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  39.1 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  39.64 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  40.37 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  38.58 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  41.08 
 
 		 408 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  41.2 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  38.62 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  41.59 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  40.81 
 
 		 407 aa  280  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  40.57 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  40.55 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  40.32 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  38.86 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  34.4 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.87 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 1140 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  34.7 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  34.46 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  34.46 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  34.46 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  34.46 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  33.64 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.49 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  31.53 
 
 		 436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.28 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.04 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  31.88 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  32.48 
 
 		 421 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.65 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  29.59 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  35.02 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  35.02 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  30.43 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.3 
 
 		 423 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.9 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  30.94 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.66 
 
 		 415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  35.1 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.41 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.33 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  30.96 
 
 		 426 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  32.4 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  30.91 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.24 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  31.85 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.38 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.57 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  29.57 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  31.09 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  29.95 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  31.41 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  30.65 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.37 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  31.49 
 
 		 420 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.57 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  30.82 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.57 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  32.4 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  34.76 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  29.53 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  33.03 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  29.49 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  28.19 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  30.72 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  29.08 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.85 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  29.57 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  28.85 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  28.85 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  28.85 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  26.2 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  28.61 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  28.44 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>